| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,397,239 | Δ10,478 bp | IS5‑mediated | ynaJ–[dgcM] | ynaJ, uspE, fnr, ogt, abgT, abgB, abgA, abgR, mcaS, smrA, [dgcM] |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1397238 | NA (NA) | 140 (1.310) | 92/598 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1407717 = | 0 (0.000) | coding (79/1233 nt) | dgcM | diguanylate cyclase DgcM | |||||
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CGCTGATAATTTGCCGAGCGACTGGCTTTTAAACCCAGCGTTGCCGGCGCTTCGATACCTTCGAAAATAATCACCGGTTCTGTTTCTGTCAGCTTTCGCAAAACAAGCCGACAGCTCAATGCTGTTTCCTCTTCTTTACGCTGAACAGTGAGGATTTCGATAATATCGTGTTGGTTTTGCAGATCGGAGAGGTATTTCGGCAGTTCTTTTTGTGAGGAGACGGAATAGGGTCCGGTTCGTAGCTGACTAAACGTGAGGTCTTGCATCAACAGTTTCGCCGCGCTATTGGCATAAATTAACTGTTCCTCAAAGGGCGAAACGATCCAGACAGGACTGGTGAGTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGAATTTTATTAATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGCCAGAAGGCT > NC_000913/1407422‑1408014 | catttcgcatcatcaatcgacagttcggcttcgtgaaagccagatacaaggggttgctgaaaaacgataaccaactggcgatgttattcacgctgtccaacctgtttcgggcggaccaaatgatacgtcagttggatagatctcactaaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaataaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAAc < 2:330015‑M2/5‑1 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cttattcgcaccttccTTAACTGTTCCTCAAAGGGCGAAACGATCCAGACAGGACTGGTGAGTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATNTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGAATTTTATTAATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAAc < 1:609195‑M2/284‑1 (MQ=255) tattcgcaccttccTTAACTGTTCCTCAAAGGGCGAAACGATCCAGACAGGACTGGTGAGTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACNTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGAATTTTATTAATAATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAg > 2:750072‑M2/15‑300 (MQ=255) tcgcaccttccTTAACTGTTCCTCAAAGGGCGAAACGATCCAGACAGGACTGGTGAGTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGAATTTTATTAATCATTTCAGGGTAATGGGGTGATGAGATGTTGCGTAACAGGGc < 1:306241‑M2/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |