| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,078,687 | G→T | intergenic (+249/‑604) | fabY → / → yiiE | putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,078,687 | 0 | G | T | 99.1% | 771.8 / NA | 214 | intergenic (+249/‑604) | fabY/yiiE | putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (104/108); total (104/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CGAAGCCATTTGGCCCGTATGAAGAGGGCGGGAACGAAGAAGAGTAGCTGATGGAGAGGGGCGGTGCTGCCTCTCTCATTCAGGTCATTTATATTAGTCCTTGGCTATTTCGGTTATATTAAATAAGAACTCTATAAATTTTTATTCTTCGTTGGCTCCATACGTGTCTTGCTACATCACTGTTCAGGAGCATTTAAATATTATTTGTAGAACTGAGTGGCAATTATCGCAGATAATGCTTAATTCATCATCTTAGTTCATGTTTGAGCGATTTTTGATAGTCAAAACCCCCTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCG > NC_000913/4078392‑4078982 | cgAAGCCATTTGGCCCGTATGAAGAGGGCGGGAACGAAGAAGAGTAGCTGATGGNGAGGGGCGGTGCTGCCTCTCTCATTCAGGTCATTTATATTAGTCCTTGGCTATTTCGGTTATATTAAATAAGAACTCTATAAATTTTTATTCTTCGTTGGCTCCATACGTGTCTTGCTACATCACTGTTCAGGAGCATTTAAATATTATTTGTAGAACTGAGTGGCAATTATCGCAGATAATGCTTAANTCATCATCTTAGTTCATGTTTGAGCGATTTTTGATAGTCAAAACCCCCTCTTGTGc < 2:866643/300‑1 (MQ=255) 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ccTCTTGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATNTTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGAcc < 2:716339/300‑1 (MQ=255) ccTCTTGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGAcc < 1:9477/300‑1 (MQ=255) ctctTGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCg > 1:538072/1‑300 (MQ=255) | CGAAGCCATTTGGCCCGTATGAAGAGGGCGGGAACGAAGAAGAGTAGCTGATGGAGAGGGGCGGTGCTGCCTCTCTCATTCAGGTCATTTATATTAGTCCTTGGCTATTTCGGTTATATTAAATAAGAACTCTATAAATTTTTATTCTTCGTTGGCTCCATACGTGTCTTGCTACATCACTGTTCAGGAGCATTTAAATATTATTTGTAGAACTGAGTGGCAATTATCGCAGATAATGCTTAATTCATCATCTTAGTTCATGTTTGAGCGATTTTTGATAGTCAAAACCCCCTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCG > NC_000913/4078392‑4078982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |