| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 736,715 | C→T | intergenic (+16/‑1377) | ybfQ → / → ybfD | inactive transposase YbfQ/H repeat‑associated putative transposase YbfD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 736,715 | 0 | C | T | 97.6% | 395.1 / NA | 126 | intergenic (+16/‑1377) | ybfQ/ybfD | inactive transposase YbfQ/H repeat‑associated putative transposase YbfD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (73/49); minor base G (0/3); total (74/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.96e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGATATTCTACTGT‑TGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGA‑TC‑ACGT‑AACGCT‑ACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTG‑TTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATTCCCGATTACAGATAAGCCTGGAAAGTAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATT > NC_000913/736421‑736993 | tCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGATATTCTACTGT‑TGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGA‑TC‑ACGT‑AACGCT‑ACTTTTTTGTATTAaat < 1:920932/300‑1 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TCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTACACCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGTGCATAAATTGTCAGATATTCTACTGT‑TGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCCAGGGAAAGA‑TC‑ACGT‑AACGCT‑ACTTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTAAAGCTG‑TTTTTCATAGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAAATAAGGTGAACAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATTCCCGATTACAGATAAGCCTGGAAAGTAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATT > NC_000913/736421‑736993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |