| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,578,523 | IS2 (–) +5 bp | coding (200‑204/996 nt) | gntR ← | DNA‑binding transcriptional repressor GntR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 144 (1.160) | 76/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3578523 = | 0 (0.000) | coding (204/996 nt) | gntR | DNA‑binding transcriptional repressor GntR | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GCGATTGTATGTGGTCAACAAAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCG > NC_000913/2996063‑2996653 | gCGATTGCATGTGGTCAACAAAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGNGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTg < 2:833816/300‑1 (MQ=255) cGATTGTATGTGGTCAACAAAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTgg < 1:404728/300‑1 (MQ=255) aTTGTATGTGGTCAACAAAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTNTAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGAt > 2:248914/1‑300 (MQ=255) aTTGTATGTGGTCAACAAAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCATTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTCTTGGAt > 1:490308/1‑300 (MQ=255) 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gTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCgg > 1:487818/1‑300 (MQ=255) gTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCACTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCgg < 2:817897/300‑1 (MQ=255) gATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGt > 1:626009/1‑300 (MQ=40) | GCGATTGTATGTGGTCAACAAAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCG > NC_000913/2996063‑2996653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |