| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1286906 | 66 (0.530) | 8 (0.070) | 6/558 | 9.1 | 9.9% | coding (198/276 nt) | ychS | putative uncharacterized protein YchS |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 84 (0.730) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAT > NC_000913/1286609‑1287204 | cttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAc < 2:521076/300‑1 (MQ=255) tATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGNGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:661686/300‑1 (MQ=255) gACCTACATTGGAGGACATTGCATGCCCGGTAAACTGTGG‑GCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAGGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:387060/300‑1 (MQ=21) gACCTACAGTGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:737700/300‑1 (MQ=255) aCCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCt > 1:234077/1‑300 (MQ=255) aCCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgtcatctcc > 2:448082/1‑290 (MQ=255) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCGTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGGAG‑TTCAGGGGATTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCACCGCtac > 2:747146/1‑298 (MQ=18) aCAGGGGAGTAGAGTGTATGCCCGTTAAAC‑GTGGTGCCAGCGGGCAAAAGTAGCGCGGAGTAATAGGTTTTGATTATGTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTANTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAG‑TTCAGGGACTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 1:646608/300‑1 (MQ=11) aCAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTG‑GAAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttctcaccttctaagt > 2:577208/1‑286 (MQ=17) aCAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 1:502052/300‑1 (MQ=255) gtaggaTATTGTATTCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCAGCGGGCAAAAGTAGCGCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTGCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGTTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTc < 2:123789/298‑1 (MQ=21) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGcc > 1:827656/1‑300 (MQ=255) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAAACTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAG‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGTGCTTCGcc > 2:502295/1‑300 (MQ=255) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCANCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTNCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGGGAG‑TTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgacccctctacgtcgctcacg > 2:675705/1‑278 (MQ=17) gTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATGAGCTCGGAGTAACAGGTGTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAATTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCg‑gg < 2:393973/300‑1 (MQ=255) agtctcGGTAAAC‑TTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTc < 2:29924/295‑1 (MQ=255) cGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGc > 1:209766/1‑300 (MQ=255) ggTAAAC‑TTGGTACCATCGGGCAAAATTAACTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATGTGATTGCGGATTCGTGTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTTGCCCTTCA‑GGTCGTTGcc < 2:900809/300‑1 (MQ=18) c‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAG‑GGTCGctgcctgcagc > 2:453116/1‑297 (MQ=255) ccATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGTTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGGGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCTGGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCNCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGctc < 2:232534/300‑1 (MQ=255) gggCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGNTTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTNGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTCCG‑TGTCGTTGCCTGCGGCCCCGCTCTCTCg > 2:669604/1‑300 (MQ=255) tCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGc < 1:729890/300‑1 (MQ=255) gAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGACCCTTGGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCACCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGGTTCGTTTGCGCA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAATCAGCACTGCGCGCTTAGCACCTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAATGATCCCTCGCTGACGCTagagtcgg > 2:301236/1‑296 (MQ=17) gAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGAAGCTCGAGCCGa > 1:937735/1‑300 (MQ=255) gAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAACATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TNCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGa > 1:668606/1‑300 (MQ=255) tAACAGGTTGTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTTAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAAcc < 2:613899/300‑1 (MQ=255) ttgtGATCATTTAAGTGAGCGATGTTGGTGGTGGAAGGATTATTCAGCGCGGTGTGTTTCGCCCTTTGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGTTCAAGTCAAACCTTGGTCGAAGCCTCTCACCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTTAGAA‑TTCCGGTGTTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCg < 2:36484/297‑1 (MQ=17) gATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGGCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCGCGCTGGCGCTCAAGTCGAANCTTGGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATGGGATTGCGGATTCGTGTGAGAA‑TTCCGGGGCTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGc < 1:692203/300‑1 (MQ=17) acggagtcGATGGTGTTGGGGGAAGGATTATTCGGCGCTTCGCGCTTCGCTTTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGTGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTTAGAA‑TTCCTTGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCCCTCGCTGACGCTCGATCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCacc < 2:565005/293‑3 (MQ=17) aaGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATc < 1:581276/300‑1 (MQ=255) aGGAAGCGATGGTGGTGGTGGAAGGACTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTGGAAAGTGATTGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc < 1:429939/300‑1 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGACTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAGTATTGGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTGCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 1:328856/300‑1 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAttt > 1:877954/1‑300 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGATGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGCAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAatatcta > 1:462790/1‑297 (MQ=17) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCTTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGAt < 2:468501/300‑1 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAATCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑AGTCGCTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAGCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCttaacagtatgggcgggatatttgcttg > 1:499337/1‑274 (MQ=14) ttCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGagag < 1:221885/300‑1 (MQ=255) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGa < 1:914483/300‑1 (MQ=255) cGGGTAGTTGCTTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGACCCTTGGTCGAATCTTCTCATCTTTCCCCGCTTGGTCAGAATACGTAATTACGAAGTAGTGTGAGAA‑TTCCGGGGCTTGTGAAAGTGATGGGGGTGGTGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGAc < 2:153776/300‑1 (MQ=17) tctctcGCTGGCGCTCAAGTCGACCCTTGGGTGAATTTTCTTCTCCTTCCCCGCGTGGGCAGAGTATGGGATTGATGATTAGTGGGAGAA‑TTCCGGTATTTGGGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTgggg < 2:154321/300‑1 (MQ=14) tctctcGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTgggg < 1:620693/300‑1 (MQ=255) ctctcGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:880201/300‑1 (MQ=255) tctcGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTCGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGa < 1:449729/300‑1 (MQ=255) cTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAt < 1:41488/300‑1 (MQ=255) aGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:788611/300‑1 (MQ=255) gaCCTTAGTCGAAGTTTCTCATCCTTCCCCGCTGGGGCAGAATATGTGATTGCCGATTAGTTGGAGAA‑TTCCGGGGCTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 2:284104/299‑1 (MQ=17) gTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTACACGACTGGGGAGAATATTTGATTGCGGACTCGCTTTAGAGTTCCGGGGCTTTTGAAAGTGGTGGTGGTGTGGGCAAGATTACTCAGCGCTGCGTACTTCGc > 2:503849/1‑300 (MQ=17) ttCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAG‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCggg < 1:144419/300‑1 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTCCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCggg > 1:290826/1‑300 (MQ=255) 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gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTCCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCCTCGGCTCGCTGCCTACGGCACCGCTCTCTCGCTAACGCCCGAGTCGAACATTAGTCTAAGCTTCTCATCCCTCCCAGCATgggtagga > 2:147267/1‑295 (MQ=14) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTNCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCACCGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTact > 1:710302/1‑298 (MQ=255) | CTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAAC‑GTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCG‑GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAT > NC_000913/1286609‑1287204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |