| Predicted mutation | ||||||
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|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 913790 = | 0 (0.000) | coding (25/1653 nt) | hcp | protein S‑nitrosylase | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CACCAGCGCACGTAAAGAGTTACCGTGTGCAGCGATGATCACGCGCTCACCGCTCTTCATACGCGGCAGAATAGTTTCATTCCAGTAAGGGATCACGCGGTCAATGGTCAGCGCCAGGCTTTCCGTCAGCGGCAGTTCTTTCTCGCTCAGTTTCGCGTAACGCGGATCGTGACCCGGATAACGCTCATCATCTTTAGTCAGTTCCGGCGGAGTCACTGCAAAACCACGACGCCACTGTTTCACCTGCTCGTCGCCATACTTTTCAGCAGTTTCCGCTTTGTTCAGACCCTGCAACGCACCGTAGTGACGTTCGTTCAGTTTCCAGGATTTCTCAACGGGCAGCCATGCCTGATCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCAAAGTCAAAGCTGTAACCTTCCTCTTTCAGCAGCTTACCTGCTGCTTTTGCTTCGCTTACGCCTTTCTCAGACAGATCCACGTCGTACCAACCGGTGAAACGGTTTTCTTTGTTCCACTGACTTTCGCCATGACGAACCAGAACCAGCTTAGTTACAGCCATATACTTACTCCTCAAATCAT > NC_000913/787020‑787615 | cACCAGCGCACGTAAAGAGTTACCGTGTGCAGCGATGATCACGCGCTCACCGCTCTTCATACGCGGCAGAATAGTTTCATTCCAGTAAGGGATCACGCGGTCAATGGTCAGCGCCAGGCTTTCCGTCAGCGGCAGTTCTTTCTCGCTCAGTTTCGCGTAACGCGGATCGTGACCCGGATAACGCTCATCATCTTTAGTCAGTTCCGGCGGAGTCACTGCAAAACCACGACGCCACTGTTTCACTTGCTCGTCGCCATACTTTTCAGCAGTTTCCGCTTTGTTCAGACCCTGCAACGCAcc < 2:861817/300‑1 (MQ=255) 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CACCAGCGCACGTAAAGAGTTACCGTGTGCAGCGATGATCACGCGCTCACCGCTCTTCATACGCGGCAGAATAGTTTCATTCCAGTAAGGGATCACGCGGTCAATGGTCAGCGCCAGGCTTTCCGTCAGCGGCAGTTCTTTCTCGCTCAGTTTCGCGTAACGCGGATCGTGACCCGGATAACGCTCATCATCTTTAGTCAGTTCCGGCGGAGTCACTGCAAAACCACGACGCCACTGTTTCACCTGCTCGTCGCCATACTTTTCAGCAGTTTCCGCTTTGTTCAGACCCTGCAACGCACCGTAGTGACGTTCGTTCAGTTTCCAGGATTTCTCAACGGGCAGCCATGCCTGATCCAGTTCGTCCAGCACATTCCACAGGGTATGGATAGCGCGTTTCAGCACAGAAGTGTAAGCAAAGTCAAAGCTGTAACCTTCCTCTTTCAGCAGCTTACCTGCTGCTTTTGCTTCGCTTACGCCTTTCTCAGACAGATCCACGTCGTACCAACCGGTGAAACGGTTTTCTTTGTTCCACTGACTTTCGCCATGACGAACCAGAACCAGCTTAGTTACAGCCATATACTTACTCCTCAAATCAT > NC_000913/787020‑787615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |