| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,436,697 | G→A | E60E (GAG→GAA) | trkA → | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,436,697 | 0 | G | A | 98.9% | 331.3 / ‑5.4 | 93 | E60E (GAG→GAA) | trkA | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (44/48); minor base T (0/1); total (44/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGAACACCAGAGCAACCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGT > NC_000913/3436410‑3436990 | ggAACACCAGAGCAACCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCcgac < 1:127763/300‑1 (MQ=255)ggAACACCAGAGCAACCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGANGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCcgac < 1:652720/300‑1 (MQ=255) gAACACCAGAGCAACCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCcgacg > 2:680458/1‑300 (MQ=255) cacCAGAGCAACCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGacgacg > 1:792925/1‑300 (MQ=255) agagCAACCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGa > 1:467062/1‑300 (MQ=255) agagCAACCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGa > 2:495279/1‑300 (MQ=255) gCAACCGGGTAGACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAACTATCATTCTGGGTGCCGGCAAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAAACTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCCGGGGCATGGCTCCCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGAAGACGACGatat > 2:146760/1‑300 (MQ=255) aaCCGGGTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGc < 1:384491/300‑1 (MQ=255) ggTAAACAAAATCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGtt < 2:432255/300‑1 (MQ=255) aaTCTACCTGGTGCCGAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAANAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAAcc < 2:669243/300‑1 (MQ=255) 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aattgatgaGATAACTGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCTGCCAGGTTGTCTGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTNCTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAac < 2:790107/297‑1 (MQ=255) gTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCTGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAacac < 2:122436/300‑1 (MQ=255) gTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGG‑GAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAacac > 1:513117/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |