| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,640,418 | IS30 (–) +2 bp | coding (17‑18/141 nt) | yjjY → | uncharacterized protein YjjY |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4507459 = | NA (NA) | 144 (1.370) | 89/594 | 0.0 | 100% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | 118 (1.110) | 74/596 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4640418 = | 0 (0.000) | coding (17/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein YjjY | |||||
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GTTCTTACCCGGCAGATTGATATCCATGATCACCAGGTTGATGTCATATTCAGAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACTAATAAACGTGGTGAATCCAA > NC_000913/4640124‑4640717 | gTTCTTACCCGGCAGATTGATATCCATGATCACCAGGTTGATGTCATATTCAGAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgta < 1:100543‑M2/300‑5 (MQ=255) ctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCactgt < 1:733310‑M2/21‑3 (MQ=255) gATATCCATGATCACCAGGTTGATGTCATATTCATAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGGCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCNTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaatctgtcaatgc > 2:209596‑M2/1‑278 (MQ=255) gATATCCATGATCACCAGGTTGATGTCATATTCAGAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaatctgtcaatgc > 1:41302‑M2/1‑278 (MQ=255) atatCCATGATCACCAGGTTGATGTCATATTCATAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaatctgtcaatgca > 2:758504‑M2/1‑277 (MQ=255) aaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATc < 2:519917‑M2/26‑1 (MQ=255) atCCATGATCACCAGGTTGATGTCATATTCAGAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaatctgtcaatgcaac > 1:369666‑M2/1‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |