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aaatccaCCAAAGACCTGGTTGATGTCGTAACCGGTGATATCACCACTATCCAGTCGTTACGCCATACCTCCGATCTTGATACCGGAGAGATGTATGTCTTCCTGTGTAAGGTTGAAGCCTGGGCGATGAATATTGGTTGCCACCTGACTATTCCACAGAGCTGCGAGTTCCAGCTGCTGCGCGACAAGCAGGAGGCGTAATGGCTACACCGCTTATTCGTGTCATGAACGGACACATCTACAGAGTACCAAATCGTCGTAAGCGTAAACCTGAGCTGAAGCCATCCGAAAGACCAacac < 1:511293‑M2/293‑1 (MQ=255) ccaCCAAAGACCTGGTTGATGTCGTAACCGGTGATATCACCACTATCCAGTCGTTACGCCATACCTCCGATCTTGATACCGGAGAGATGTATGTCTTCCTGTGTAAGGTTGAAGCCTGGGCGATGAATATTGGTTGCCACCTGACTATTCCACAGAGCTGCGAGTTCCAGCTGCTGCGCGACAAGCAGGAGGCGTAATGGCTACACCGCTTATTCGTGTCATGAACGGACACATCTAAAGAGTACCAAATCGTCGTAAGCGTAAACCTGAGCTGAAGCCATCCGAAATACCAACACTGCt > 1:412375‑M2/4‑300 (MQ=255) caCCAAAGACCTGGTTGATGTCGTAACCGGTGATATCACCACTATCCAGTCGTTACGCCATACCTCCGATCTTGATACCGGAGAGATGTATGTCTTCCTGTGTAAGGTTGAAGCCTGGGCGATGAATATTGGTTGCCACCTGACTATTCCACAGAGCTGCGAGTTCCAGCTGCTGCGCGACAAGCAGGAGGCGTAATGGCTACACCGCTTATTCGTGTCATGAACGGACACATCTACAGAGTACCAAATCGTCGTAAGCGTAAACCTGAGCTGAAGCCATCCGAAATACCAACACTGCTc < 1:525002‑M2/298‑1 (MQ=255) 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ATCTAGCGTTTGACCTCTGCGGAGGGGAAGCGTGAACCTCTCACAAGACGGCATCAAATTACATCGCGGCAACTTCACCGCTATCGGTCGGCAGATCCAGCCTTATCTGGAGGAGGGCAAATGCTTTCGCATGGTGCTTAAACCGTGGCGTGAGAAACGCAGTCTTTCCCAGAATGCACTCAGCCACATGTGGTACAGCGAAATCAGTGAATACCTCATCAGCAGGGGTAAAACGTTCGCCACTCCAGCTTGGGTAAAAGATGCTCTCAAACACACATATCTCGGTTATGAAACCAAAGACCTGGTTGATGTCGTAACCGGTGATATCACCACTATCCAGTCGTTACGCCATACCTCCGATCTTGATACCGGAGAGATGTATGTCTTCCTGTGTAAGGTTGAAGCCTGGGCGATGAATATTGGTTGCCACCTGACTATTCCACAGAGCTGCGAGTTCCAGCTGCTGCGCGACAAGCAGGAGGCGTAATGGCTACACCGCTTATTCGTGTCATGAACGGACACATCTACAGAGTACCAAATCGTCGTAAGCGTAAACCTGAGCTGAAGCCATCCGAAATACCAACACTGCTCGGATAT > NC_000913/572435‑573031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |