| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 321,371 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (+290/‑229) | rclR → / → ykgE | DNA‑binding transcriptional activator RclR/putative lactate utilization oxidoreductase YkgE |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 122 (1.150) | 81/598 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 321371 = | 0 (0.000) | intergenic (+290/‑237) | rclR/ykgE | DNA‑binding transcriptional activator RclR/putative lactate utilization oxidoreductase YkgE | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 137 (1.290) | 79/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 321379 | 0 (0.000) | intergenic (+298/‑229) | rclR/ykgE | DNA‑binding transcriptional activator RclR/putative lactate utilization oxidoreductase YkgE | |||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
TGCACCCTGAATAAAACCGCCAGAAATCAGGGCAAAGATAATCCGCATTCCGGGAGTTGTGAGCCTTTCAACTATTTCTATTTCCAACGGTGGTTTGGGCTTTATATATTTTTTCTGATGGACTCTAGCTCAGTTTTTAAATAAAAATGCAAACTAAATTGCTTCAATTAAATAAAATCCCGACTATTACTTGATACGTGATTATTGTCGGTGATTTTTTTGTACACCATCAGTGTATATCTCAATAACCCCTGAATAAGTAGCTCTGAATAGGTATAAGGGATGTAGCCATTTTTAAATGGATTTCTTATGCCAAAAATGATCGTCGATTTCCCCATAAAATGTGAGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGAC > NC_000913/321072‑321670 | atGAATAAAACCGCCAGAAATCAGGGCAAAGATAATCCGCATTCCGGGAGTTGTGAGCCTTTCAACTATTTCTATTTCCAACGGTGGTTTGGGCTTTATATATTTTTTCTGATGGACTCTAGCTCAGTTTTTAAATAAAAATGCAAACTAAATTGCTTCAATTAAATAAAATCCCGACTATTACTTGATACGTGATTATTGTCGGTGATTTTTTTGTACACCATCAGTGTATATCTCAATAACCCCTGAATAAGTAGCTCTGAATAGGTATAAGGGATGTAGCCATTTTTAAATGGAttt > 2:413229/2‑300 (MQ=255) tgaacgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGGATTTc < 1:684126‑M2/8‑1 (MQ=255) gAATAAAACCGCCAGAAATCAGGGCAAAGATAATCCGCATTCCGGGAGTTGTGAGCCTTTCAACTATTTCTATTTCCAACGGTGGTTTGGGCTTTATATATTTTTTCTGATGGACTCTAGCTCAGTTTTTAAATAAAAATGCAAACTAAATTGCTTCAATTAAATAAAATCCCGACTATTACTTGATACGTGATTATTGTCGGTGATTTTTTTGTACACCATCAGTGTATATCTCAATAACCCCTGAATAAGTAGCTCTGAATAGGTATAAGGGATGTAGCCATTTTTAAATGGATTTCt > 1:394190/1‑300 (MQ=255) acgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGGATTTCTTa < 1:807728‑M2/11‑1 (MQ=255) 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TGCACCCTGAATAAAACCGCCAGAAATCAGGGCAAAGATAATCCGCATTCCGGGAGTTGTGAGCCTTTCAACTATTTCTATTTCCAACGGTGGTTTGGGCTTTATATATTTTTTCTGATGGACTCTAGCTCAGTTTTTAAATAAAAATGCAAACTAAATTGCTTCAATTAAATAAAATCCCGACTATTACTTGATACGTGATTATTGTCGGTGATTTTTTTGTACACCATCAGTGTATATCTCAATAACCCCTGAATAAGTAGCTCTGAATAGGTATAAGGGATGTAGCCATTTTTAAATGGATTTCTTATGCCAAAAATGATCGTCGATTTCCCCATAAAATGTGAGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGAC > NC_000913/321072‑321670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |