| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2817942 | 80 (0.750) | 5 (0.050) | 5/558 | 8.9 | 6.1% | intergenic (‑82/+117) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
| ? | NC_000913 | 2818492 = | 79 (0.800) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTT > NC_000913/2817648‑2818237 | agaTGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTCCTAAAGCCATCCCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCg > 1:229727/1‑300 (MQ=255) cATCCGGGAGGATGACCCACTGACGTTCGCCCTGCGGGCCGTTGCTGACGCAACGTGATCCTTCCGGGTGCCTGCGGGTAATACCGCTATCTCTTCGGTACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTGCTCTATCCAACTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCTATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCgg < 2:96812/300‑1 (MQ=18) aTCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAACCTTATTCCACTGTTAATATT‑‑GATCCCTCTAATAAAGCCATGTCAATTAAGAGATGGTGAATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGc > 1:573592/1‑300 (MQ=18) ggaTGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCtt > 2:814611/1‑300 (MQ=255) aCTCGCTGACGGTCGCCCTTCTGGCCGTTGCTTGCGCAGCGTTATCCTTCCTGGTGCCT‑CGGGTAATACCGCTATCTCTTAGATACCTTCATTGCTGAAGGTGACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGTATTCGAACCTCCGACCGCTCGTTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCATCTG‑AGCTACGGAGGCGTCGGGAAAACCTATTCTACTGCTAATATC‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCTGTAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGcc < 2:237995/300‑1 (MQ=21) aCTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAA‑TTTATTTTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGAttcgaacctccgaccgctcggttcgtagcc > 1:712409/1‑272 (MQ=11) aCTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCTATCTCTCCTATATATCTCCACTACCACAAGTCAAGGAAGGTATGGTGCATCGGGGGGGGTTAGAACCTACGAACGATAGGGTCGTAGCAGAGTACTATATCAAGCTG‑AGCTACGGATGAATCGGGAAAGCTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACTGCTAATAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGGTTACTCGCCCTGCGGCTCGCCCTTCGGGc > 1:344155/1‑300 (MQ=255) cTCACTGACGTTCGCTCTTCGTGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGcc < 2:425445/300‑1 (MQ=255) cTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACTGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGcc < 2:475137/300‑1 (MQ=255) tCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCATGGTGCCNGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAGGGCTACGGAGACTATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCCACTGCTGCTATT‑‑GATAACGCTACTAAAGCCAGCTCAATNAAGAGATGGTGCATCCGGGGGGGTTCCTCGACTTGCAGCTCGCCCTTAgggacg > 2:840979/1‑297 (MQ=18) 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cGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATcc < 1:292487/300‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCt < 1:408534/300‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTACTACCGCTATTTCTCCGCCACTTTCATTGATGAAGGTTAAGGAAAATCTGATACACCCGGGAGGCTTCGCACCTCCAAACGCTCGATTCGTAGCCGAGTAATCTATAAAGCTG‑AGCTAAGGATGCATCGGGAAAATTTCTTTCACGGCTACTATT‑‑GATCACGATACCAAAGCCATCCCAATGAGGGGGGGGTGACTCCGGGAGGGTTACTCACCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTCAAGcccagttatcaccgcta > 2:378036/1‑284 (MQ=255) gCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAg < 2:493307/300‑1 (MQ=255) taaagcAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATC‑AGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAA‑CTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTg < 1:317858/296‑1 (MQ=11) tGGCGCAACGTTGTCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCTGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGGNTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGAGGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTg < 2:200432/300‑1 (MQ=255) 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tCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTAATGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGt > 1:895805/1‑300 (MQ=11) gACCGCGCGTTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCGG‑AGCTACGGAGGCATCGGGAAAACTTACTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATAGCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCGCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTAc < 1:765119/300‑1 (MQ=255) aagagacaggTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCTGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTAc < 2:564495/292‑1 (MQ=255) 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ttCGTAGCCGAGTACTCTATCCACCTG‑AGCTACGGATGTATCGGGAAAAACTACTCTATTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAAATGGTGCATCCTTGAGGATGACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGc < 1:212370/300‑1 (MQ=18) cGTAGCCGAGTACTCTAGCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACGTATTCGACTGCTGGGAGT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAGTTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGGTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGNGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGNTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTg < 2:623417/300‑1 (MQ=18) aGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGc < 1:741959/300‑1 (MQ=255) 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AGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTG‑AGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTT > NC_000913/2817648‑2818237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |