| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GGTTCAGCTTCATCATGGATATCCGTAAGGCCCGGCAGTTCGACGTCTACGTCAATGACCAGAAAGTTGGATCGTTTAACCCTGATGTTCGGAATGCACAAAAGGTCCTGCCAACATTAGCGGACTGCACTAACGACTGACGGCTGCGCCTTCCCTACCATAACAACCCTGATTGCCTCCGGCGGTCGGGGGTTTCTTTTTTCTCCTTAATCTCCAGAGGTAGGCCACGTACTTTCGAACGATGAGCGCAGTGGTCAGTTTTTTTCAGATATATTTATCTTTTTTTGGCTGTAAGCTCCGCTGTGAGCGCAGGCTGTGTTAAAACTCCTGATCACTTTTTGGTCTAAGCGATGGTTTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCG > NC_000913/2771476‑2772074 | ggTTCAGCTTCATCATGGATATCCGTAAGGCCCGGCAGTTCGACGTCTACGTCAATGACCAGAAAGTTGGATCGTTTAACCCTGATGTTCGGAATGCACAAAAGGTCCTGCCAACATTAGCGGACTGCACTAACGACTGACGGCTGCGCCTTCCCTACCATAACAACCCTGATTGCCTCCGGCGGTCGGGGGTTTCTTTTTTCTCCTTAATCTCCAGAGGTAGGCCACGTACTTTCGAACGATGAGCGCAGTGGTCAGTTTTTTTCAGATATATTTATCTTTTTTTGGCTGTAAGCTCCg < 2:50147/300‑1 (MQ=255) 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gCTGTAAGCTCCGCTGTGAGCGCAGGCTGTGTTAAAACTCCTGATCACTTTTTGGTCTAAGCGATGGTTTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTACAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCACTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGCAATAAGTTTAATCAGTTCATCAAGGGTCGGTGGCATATCGAGATaattaatt > 2:527563/1‑300 (MQ=255) agtctaCTCCGCTGTGAGCGCAGGCTGTGTTAAAACTCCTGATCACTTTTTGGTCTAAGCGATGGTTTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAANTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCNGGCATCAGGTGAAATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCAAGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAattat < 2:713142‑M1/294‑1 (MQ=255) aGCTCCGtggatttgcccttagatttccagacatctgtgctcacttaacccactacaagcccgctgccgcagatattcccgttgcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcggtatgatgctcgaacgcctctgcaagtttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcactaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgtgcttcggttcaagtcccaacatccgggcgaactggcg < 2:157736‑M1/300‑294 (MQ=255) 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GGTTCAGCTTCATCATGGATATCCGTAAGGCCCGGCAGTTCGACGTCTACGTCAATGACCAGAAAGTTGGATCGTTTAACCCTGATGTTCGGAATGCACAAAAGGTCCTGCCAACATTAGCGGACTGCACTAACGACTGACGGCTGCGCCTTCCCTACCATAACAACCCTGATTGCCTCCGGCGGTCGGGGGTTTCTTTTTTCTCCTTAATCTCCAGAGGTAGGCCACGTACTTTCGAACGATGAGCGCAGTGGTCAGTTTTTTTCAGATATATTTATCTTTTTTTGGCTGTAAGCTCCGCTGTGAGCGCAGGCTGTGTTAAAACTCCTGATCACTTTTTGGTCTAAGCGATGGTTTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCG > NC_000913/2771476‑2772074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |