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ccGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGtctgtctcttatacaca > 1:264510/1‑284 (MQ=255) ccGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGGTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGTTGCGTCGTTGCTGACt > 1:824615/1‑300 (MQ=255) agtctaTTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGTTGCGTCGTTGCTGACTTAACg < 1:11178‑M1/294‑1 (MQ=255) 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TTGTTTCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGCGGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGAATTGATCAATCCTTCTGGCAGATTAAGCCAAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGTCTGGATTATGTGATTATTAATTTAACTCCAGAAAGC‑AAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATGAAAGTGAAACACTTACCCGTAGAAATGACGCTATCTTCGGCAACCACGTATGGC‑AAACATTTGCGCAATACTTCCCGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGACAACGCCATCCGGAGAAGCCGAATGACGTTGTCGGAGTAAGCGCTGGTTAAGGTGTGGGTTGTGCCTCTTTGGTTGAGGGTTGCGTCGTTGCTGACTTAACGGTCGG > NC_000913/1245141‑1245738 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |