New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 781016 | 47 (0.440) | 4 (0.040) | 3/524 | 9.8 | 5.9% | intergenic (+98/‑52) | lysW/valZ | tRNA‑Lys/tRNA‑Val |
? | NC_000913 | 781809 = | 86 (0.920) | intergenic (+157/‑276) | lysQ/nadA | tRNA‑Lys/quinolinate synthase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCA‑TCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACC > NC_000913/780717‑781315 | gCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCCGCTGGGAGAGCACCTCCCTTCCACGGAGGGGGTCGGCGGTTCGACCCCGTCATCACCCACCACCGAGTCGTTAGCTCAGTTGGTCGAGCAGTCGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGACCGACCCAACATT‑TCTCAAATCAAAAACAGACGTTAAACGTGTAAGATAACGTTGCGTCAGAACCGGCCGGTAAGGTGAGCGAAGCGAGTCGCCCTGCACGACccacca > 2:360144/1‑300 (MQ=14) tatgACCCACCGCTGAAATAGTTATGTGTAGTATCCAGAGTGTTATCGGGTGATTAGTTCAGCGGTTAGGACACTTCCCTTACAGGTAGGGGGTCTACGGTTCGATCCCGTCGCCACTAAACATCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCcaccac < 2:198364/297‑1 (MQ=14) cgctaCCCACCGCTAACGTAGTTGGTTGTGGTATCCAGCGTGGTGTTGGGTGATTAGCTCGGAGGGGAGAGCGCTTCCCTTACGAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCcaccac < 2:493770/296‑1 (MQ=14) cactaCCCACCACGAACATAGTTAGTTGGAATATCCAGCGTAGTGTCGGGTGATTAGCTCAGCGGTTAGAGCACCTCCCTTACACGGATGTGGGCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCAACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TGTAACATCGAAGACAGAGGTGAAGCGTGGAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGGAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCcaccac < 1:501041/296‑1 (MQ=14) cACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCcaccac < 1:789807/300‑1 (MQ=255) cACGACCCACCACTAACATAATTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCcaccac < 1:126493/300‑1 (MQ=255) aCCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTCACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCaataat > 1:900010/1‑300 (MQ=255) 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gTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTAt < 1:132238/300‑1 (MQ=255) gCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAACCAGATGTTAAGCGTGTAGGGTAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAAGGCGCGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAACCACCAATCATGACGGTTGGTCCGGTGGAAGGAGTTTTTCGGATACAGCGCAGTGTGGGGTgggtagc > 1:881232/1‑294 (MQ=14) tCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCCATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCCGT‑TTTAACATCGAAAACAGAGGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTAAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCGTCCTGCACGAACCACCAATAATGAAGGTGGGTTCGGGGGGAATAGTTTGTAGTATCCAGCGCAATATGGGGTGGTCAGCTTCGCTGGGAGAGc > 2:59961/1‑300 (MQ=17) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTTGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAT‑TTCAAAACCGCCGATCGAAGTTACATACGTACAACCACGTCGAGCCAGACACTGCAAGTAGGGCGAGTGAAGCGAGTCATCCTGAACGAACCACCAATAATGAAGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATACAGCGCAGTATCGGGTGGTTAGCTCAGATGGGagagta > 1:100575/1‑298 (MQ=9) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCa > 1:274339/1‑300 (MQ=255) ccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGTTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCNTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCAc < 1:605341/300‑1 (MQ=255) 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aTCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCA‑TCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGagcgaagcg > 1:449517/1‑300 (MQ=255) tGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCA‑TCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTc < 1:121665/300‑1 (MQ=255) cGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCA‑TCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAAATCAGATGTTAAGCGNGAAGGATAACGTTGCGCAAACAAAGGCAAGTAGGGCGAGCGAAGCGANTCaccc > 2:743815/1‑297 (MQ=255) cgccacTAATGACGGTTGGTTCTGTGGAAGTGGTTTTTAGTATCCAGCGTGATATCTGGTGATTAACTCAGCTGGGAGAACAACCCCCTTACAAGGGGGGGGTCTGCTGTTCGATCCCGTCA‑CCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGGAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCAc < 2:502759/298‑1 (MQ=14) ccacTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCA‑TCACNCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGNTAGAGCAGTTGCCTTCTAACCACTTAGTCGCAGGTCCTCATCCTACACTACCCACCAATTTTAACCTCCACCTCCTCCGTTAATCGCGACGTCCCCCGTTGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGTGAGTCATCCTGCACGa > 2:607873/1‑300 (MQ=17) acTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCA‑TCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAcc > 1:851028/1‑300 (MQ=255) | GCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT‑TTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCA‑TCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACC > NC_000913/780717‑781315 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |