| New junction evidence | |||||||||||
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CCGTTCTTCCATAGTTCCAACACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTCAATGTTCGTCTCCTTCCAACCACCTCCGCAACCCCCTGTTTTCCCATAACTGTTGCGTTGACCACTTGCCTCTACAGGTGTGATTCTCGCTTTCAGCCAGCTGATCGCTTATAGCTGGCTTACAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGTCTGTCGCCGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTAGTTTTTCCATTCCGAT > 2:423526/1‑300 TTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTT > 1:384439/1‑300 CATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGC < 1:71124/300‑1 GCTGTAAATGTTCGTCTAATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGAACTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGCACTCTATCGGTGGCAAACT > 1:453832/1‑300 CTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTG > 1:171021/1‑300 aagagacagCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCATTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATC < 2:764100/291‑1 CCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCctgtctctt > 1:782433/1‑291 agCCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGGTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGT < 2:95057/298‑1 CCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTNGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTA > 1:650895/1‑300 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTAC < 1:546763/300‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCATTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAG > 2:451324/1‑300 TCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTACTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAGCCGA > 1:315804/1‑300 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCATTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCAAGCCGACGCAACTG > 2:63309/1‑300 ATCTACAGGTTTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAGCCGACGCAACTGCTGAACTTCGATCCCAGCAC < 1:566261/300‑1 ATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTTTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAGCCGACGCAACTGCTGAACTTCGATCCCAGCAC < 2:416232/300‑1 ATCTACAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAGCCGACGCAACTGCTGAACTTCGATCCCAGCAC < 1:343511/300‑1 CAGGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAGCCGACGCAACTGCTGAACTTCGATCCCAGCACTATGC < 1:112528/300‑1 CAGGTGTGATACTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAGCCGACGCAACTGCTGAACTTCGATCCCAGCACTATGC < 1:184437/300‑1 GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1469593‑1469296‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGTGATCCTCGCTTTCAGCCAGCTGATTGCTTATAGCTGGCTTAAAATTCCTGCTGAGATCGGCATCATGGATGCTCTTAATAGCGGGAAATTCTCCGGTTTCGACCTCTCCTTACTTAAATTTGCCTGGCTGTCGCAGTCCTTCGGCGGCGTGTTGTTTGGTTTTGCCATTCCGATGTTTGCTGCTTTTGTGGCGAACTCTATCGGTGGCAAACTGGCGTTCCCGGCTGGTTTTATCGGCGGGTTGATGTCTACCCAGCCGACGCAACTGCTGAACTTCGATCCCAGCACTATGC < NC_000913/2507735‑2507438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |