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gctgtcacTGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCCACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGACTCTCCACTCACCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTCGATTAGCCTTTATATCGACCGCTTCGTTAACCGCGATATGTTTGGTTATACCGTTCCGACCGCGATGTTCAAGTCGATTAATGCCTTCGCAGCTATGCTGTGCGGTGTGTTCCTGGCGTGGGTGGTAAAAGAGAGTGTAGCGGGTAATCTTACCGTGCGCATCTG > 1:743059/9‑300 GCTGTAAATGTTCGTCTAATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGAACAATTGAATCTACACTCACCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTAGATTAGCCTTTATATCGAACGCTTCGTTAAATGCGATATGTTTGGTTATCCCGTTCCGACCGCGATGTTCCAGTCGATTAATGCCTTCGCAGTTATGCTGTGTGGTGTGTTCCTGGCATGGGTGGTAAAAGAGAGTGTCGCGGGTAATCGTACCGTGCGCATCTG > 2:109157/1‑300 CCGCAANCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACACTCNCCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTCGATTAGCCTTTATATCGACCGCTTCGTTAACCGCGATATGTTTGGTTATACCGTTCCGACCGCGATGTTCCAGTCGATTAATGCCTTCGCAGTTATGCTGTGCGGTGTGTTCCTGGCGTGGGTGGTAAAAGAGAGTGTCGCGGGTAATCGTACCGTGCGCATCTGGGGGAAATTTGCTCTTGGCCTTGGCCTGATG < 2:734801/300‑1 CCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACACTCACCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTCGATTAGCCTTTATATCGACCGCTTCGTTAACCGCGATATGTTTGGTTATACCGTTCCGACCGCGATGTTCCAGTCGATTAATGCCTTCGCAGTTATGCTGTGCGGTGTGTTCCTGGCGTGGGTGGTAAAAGAGAGTGTCGCGGGTAATCGTACCGTGCGCATCTGGGGGAAATTTGCTCTTGGCCTTGGCCTGATG < 1:134861/300‑1 GAATCTACACTCACCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTCGATTAGCCTTTATATCGACCGCTTCGTTAACCGCGATATGTTTGGTTATACCGTTCCGACCGCGATGTTCCAGTCGATTAATGCCTTCGCAGTTATGCTGTGCGGTGTGTTCCTGGCGTGGGTGGTAAAAGAGAGTGTCGCGGGTAATCGTACCGTGCGCATCTGGGGGAAATTTGCTCTTGGCCTTGGCCTGATGAGCGCCGGATTCTGCATTCTGACCTTAAGCGCCCGCTGGTCC > 1:265726/1‑300 AATCTACACTCACCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTCGATTAGCCTTTATATCGACCGCTTCGTTAACCGCGATATGTTTGGTTATACCGTTCCGACCGCGATGTTCCAGTCGATTAATGCCTTCGCAGTTATGCTGTGCGGTGTGTTCCTGGCGTGGGTGGTAAAAGAGAGTGTCGCGGGTAATCGTACCGTGCGCATCTGGGGGAAATTTGCTCTTGGCGTTGGCCTGATGAGCGCCGGATTCTGCATTCTGAACTTAAGCGCCCGCTGGTCCG > 2:842948/1‑300 CACTCACCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTCGATTAGCCTTTATATCGACCGCTTCGTTAACCGCGATATGTTTGGTTATACCGTTCCGACCGCGATGTTCCAGTCGATTAATGCCTTCGCAGTTATGCTGTGCGGTGTGTTCCTGGCGTGGGTGGTAAAAGAGAGTGTCGCGGGTAATCGTACCGTGCGCATCTGGGGGAAATTTGCTCTTGGCCTTGGCCTGATGAGCGCCGGATTCTGCATTCTGACCTTAAGCGCCCGCTGGTCCGCAATGT > 2:681393/1‑300 TGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270831‑270541 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTCACCTTCTTCAGTATGTTGTTCTGGGCCTTCGCACAACAGGGCGGTAGCTCGATTAGCCTTTATATCGACCGCTTCGTTAACCGCGATATGTTTGGTTATACCGTTCCGACCGCGATGTTCCAGTCGATTAATGCCTTCGCAGTTATGCTGTGCGGTGTGTTCCTGGCGTGGGTGGTAAAAGAGAGTGTCGCGGGTAATCGTACCGTGCGCATCTGGGGGAAATTTGCTCTTGGCCTTGGCCTGATGAGCGCCGGATTCTGCATTCTGACCTTAAGCGCCCGCTGGTCCGCAATGT < NC_000913/741740‑741443 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |