| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 270541 = | NA (NA) | 59 (0.560) | 48/594 | 1.0 | 52.2% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 419643 | 54 (0.510) | coding (53/1320 nt) | brnQ | branched chain amino acid transporter BrnQ | |||||
GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270838‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAACCAGAGGTATATAGCGATAAG < NC_000913/419643‑419348 GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAA < 1:72238/300‑1 GCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGC < 1:813696/300‑1 AAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCNTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACNTAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGAT < 2:838865/300‑1 ACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATAT < 1:358768/300‑1 cgcgagcgCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATTGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCTGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATT < 1:325005/292‑1 CGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGTCTGTTCCGTTCTTCTATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATG > 2:350795/1‑300 CGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATG > 2:293596/1‑300 ataagagacagGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAA < 1:704309/289‑1 GTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCNTGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCNTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCCTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAAT > 2:630487/1‑300 GTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAAT > 1:33447/1‑300 GTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTATGCTGTANATGTTCGTCTAATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAAT > 2:228594/1‑300 GTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCA > 1:864622/1‑300 AGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGGGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATAC < 1:258867/300‑1 GGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACT > 1:228914/1‑300 GTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCATTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTAGTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTG < 2:10023/300‑1 GAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAActgtctcttat > 2:688417/1‑289 GCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTG > 2:68169/1‑300 GCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTG > 1:816927/1‑300 CAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGA < 2:754795/300‑1 CAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGA < 1:711847/300‑1 GCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGTTCATAAATCATACTGCCTGTGGATG < 1:252686/300‑1 GCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATG > 2:532363/1‑300 cccacgtGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACACATTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCATTGAAGCCTTTTCCGGTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAA < 2:334071/293‑1 GTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAAT > 1:376114/1‑300 GTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTACCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAAT > 2:416854/1‑300 TCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTG > 1:139585/1‑300 TAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTTTGCTTTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTTTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATAC < 1:448940/300‑1 TAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATAC < 1:506101/300‑1 ACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGC > 1:906139/1‑300 ATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCACAAC > 2:400819/1‑300 ACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGC > 2:429325/1‑300 AGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCACAACCAGGCGCGGC > 1:579658/1‑300 GTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGA > 1:775952/1‑300 GTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGCGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCCATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCAAACCAGGCGCGGCGAAGA > 2:4606/1‑300 TTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCAAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTT > 2:475083/1‑300 TTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCATGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTT > 1:147355/1‑300 GTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTA > 1:355601/1‑300 GAGGCTGTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGTCAATCCCTGTGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATG < 2:344254/300‑1 GGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCA > 1:561508/1‑300 TTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATNATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTANCGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCA < 2:601264/300‑1 CTGCTGTAAATGTTCGTCTCAGTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGAC < 1:43990/300‑1 GCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAG > 2:399670/1‑300 GCTGTAAATGTCCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCGCTTGAATCTACAAATGTCATAACGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCATGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCACAAACAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTAAGTATGACAG > 2:51806/1‑300 CTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTNATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATNCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAAACAGGCGCGGAGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGC > 2:709827/1‑300 TAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATATTTTCACGTAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGGCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGGCGTAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTGAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTCTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACC < 2:472740/300‑1 TCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTTAAGCG < 2:328980/300‑1 CTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTTAAGCGCAATTTAAACGCTTATAA < 1:73377/300‑1 CCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAG < 1:337581/300‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATCCAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGACCTCAATTGATGGGCCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGACATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGCATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGCAACGAAATTTAAACACTTATAACGTTTTAAAGCAAG > 2:484029/1‑300 TTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGG > 1:403347/1‑300 TAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCT > 1:561344/1‑300 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTNTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCANCCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAA > 2:714891/1‑300 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAA > 1:318371/1‑300 CCAATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAACCAGAGGTAT > 1:511849/1‑300 AATTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGTGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAACCAGAGGTATAT < 1:296017/300‑1 TTGAATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAACCAGAGGTATATAG < 1:732031/300‑1 AATCTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAACCAGAGGTATATAGCGA < 1:486548/300‑1 CTACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATNTCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATANAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAAACAGAGGTATATAGCGATAA > 2:642683/1‑300 TACAAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCACAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAACCAGAGGTATATAGCGATAAG > 2:813418/1‑300 GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270838‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caAATGTCATAAAGCCCAGAGCGATGATATCGCGCGATCTTAATTGATGGGTCATAAATCATACTGCCTGTGGATGTGGTGTTGTAACGTTAAATTTTTGTGCCAATCCCTGGGGATGATACAGCGGTATATTTAAACAATTTTAGCGGGAAATACTCCCAACCAGGCGCGGCGAAGAATAGTTTTTCGATTTACCGCGTTAATGCAGTCAGTATGACAGCACCTGAAGCGCAATTTAAACGCTTATAACGTTTTAAAGCAAGGAGGGATCTAAAAACCAGAGGTATATAGCGATAAG < NC_000913/419643‑419348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |