| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,282,332 | (A)5→6 | coding (744/1293 nt) | yjcF ← | pentapeptide repeat‑containing protein YjcF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,282,332 | 1 | . | A | 97.8% | 480.8 / 2.8 | 135 | coding (744/1293 nt) | yjcF | pentapeptide repeat‑containing protein YjcF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base A (56/76); total (58/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑A‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAGG > NC_000913/4282034‑4282623 | cagaacagTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑Taaa‑a‑aa > 1:731549/1‑299 (MQ=255) gCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCaagga < 1:438793/300‑1 (MQ=255) gCAATTCCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAAGTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCANAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGNATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCaagga < 2:621544/300‑1 (MQ=255) cAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCaaggaa < 2:85832/300‑1 (MQ=255) gCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAACTCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTAt > 1:181593/1‑300 (MQ=255) gCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTAt > 1:508656/1‑300 (MQ=255) tAAATTGACAGTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTAtttt < 2:61282/300‑1 (MQ=255) ggCATTATTAAAATTAACATGAGCCATATTAGATTCGGGACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAatat < 1:436619/300‑1 (MQ=255) aaTTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTAttt > 2:30939/1‑299 (MQ=255) aCATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTTCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTNAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAANGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCAttgt < 2:703634/300‑1 (MQ=255) aCATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCAttgt > 1:225287/1‑300 (MQ=255) aGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCAt < 1:168889/300‑1 (MQ=255) gCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCAtt > 1:712360/1‑300 (MQ=255) cATATTATATTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGt < 1:424812/300‑1 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTTCTATCCACTCAGTTTATCTTCTGGAGGGTTTCTTTCTTCAGGTTTAACCGAGACAGATCCGCCCTTTCAAAATTAATTCAATCCAGTTTCAG‑GAAGCTAAGGTCGGCTCCCAATCAATTCATATCTTGTGCTCCTCCCTTCCAAAGATTTCCCTCAGCCACGTACGCCCCACAAAA‑A‑A‑TTTGAATAATCAAGGGAGGTGCTTTTaagcttggccccccttagtgttgtattgta > 2:810089/1‑272 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTa > 2:128023/1‑300 (MQ=255) atatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAAGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCACAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAGTAATCAAGGAAGGTATTTTTAGTATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTa > 1:205689/1‑300 (MQ=255) tatTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGACATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGTATTGTAg > 2:402508/1‑300 (MQ=255) tAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTNGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAAt < 2:778928/300‑1 (MQ=255) tAGAGTCGATACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAAt < 2:175840/300‑1 (MQ=255) tCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTCATATTCTGTAGGGTGGCTTGATTCAGGTGGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑AGA‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCAGTGTTGCATTGTAGAATTGAAc < 2:533505/300‑1 (MQ=255) cGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACa > 2:48373/1‑300 (MQ=255) gTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTCATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAAcctg > 2:124385/1‑297 (MQ=255) aCATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATGTTGGCTCTATTCATTGTTGCACTGTAGAATTGAACATGCa > 1:248380/1‑300 (MQ=255) aCATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCa > 2:541101/1‑300 (MQ=255) aCATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCGTTGTAGAATTGAACATGCa > 2:86836/1‑300 (MQ=255) cATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGTAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCAt < 1:284999/300‑1 (MQ=255) cATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAAGA‑A‑TTTGAATAATCAAGGANGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAANATGCAt > 2:741351/1‑300 (MQ=255) cATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGANGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAANATGCAt > 2:741374/1‑300 (MQ=255) cATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCAt < 1:438441/300‑1 (MQ=255) cATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCAt > 2:238216/1‑300 (MQ=255) atatAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAANGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACNTGCATa > 2:737430/1‑300 (MQ=255) atatAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATa > 1:113063/1‑300 (MQ=255) taACCATTTCTAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCGATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCg < 2:356214/300‑1 (MQ=255) ccATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGaa > 1:836292/1‑300 (MQ=255) aTTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACa > 2:77217/1‑300 (MQ=255) cGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAAtctgtctcttatacacatctcgcag < 1:489319/300‑25 (MQ=255) aaCGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTag < 2:401703/300‑1 (MQ=255) gTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGt < 1:684654/300‑1 (MQ=255) gTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTGGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGATAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATGTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCgtc < 2:346356/300‑1 (MQ=255) gcgTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCAtt > 1:417379/1‑300 (MQ=255) cAATTAAGTTTATATTCTGTATGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACTAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑ATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTAAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAg < 1:365181/300‑1 (MQ=255) tttATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCgag < 1:864808/300‑1 (MQ=255) atatTCTTGAGGGTGGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTGATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAAt < 1:671602/300‑1 (MQ=255) atatTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACTAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATACATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAAt < 1:303116/300‑1 (MQ=255) atatTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑ATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAAt < 1:800135/300‑1 (MQ=255) atatTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATGTGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAAt < 1:156982/300‑1 (MQ=255) atatTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAGTTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAAt < 1:302673/300‑1 (MQ=255) atTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGCGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATAc > 2:571290/1‑300 (MQ=255) tCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGACTTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAGTTTGAGTCATCGAGAATACaa > 2:167095/1‑300 (MQ=255) cttgAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACTAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATGAAATCAAGTTG‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGGACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAAt < 1:397580/297‑1 (MQ=255) cTGGAGGTTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAAt < 2:276776/300‑1 (MQ=255) cTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAAt < 1:56807/300‑1 (MQ=255) gCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAg > 2:555747/1‑300 (MQ=255) gCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAg > 1:19876/1‑300 (MQ=255) aTTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTAttt > 1:190647/1‑300 (MQ=255) acacGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTAt > 2:181460/1‑300 (MQ=255) acacGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTAt > 1:4474/1‑300 (MQ=255) ataCAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGa > 1:888707/3‑300 (MQ=255) agaCAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGa > 2:443236/1‑300 (MQ=255) gATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTa > 2:574853/1‑300 (MQ=255) aGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAAt > 1:456213/1‑300 (MQ=255) gTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGtt > 1:779715/1‑300 (MQ=255) ttaatgaaATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACat < 1:28329/300‑1 (MQ=255) attaaATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATAtt < 1:55963/300‑1 (MQ=255) attaaATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAAGAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATAtt < 1:343923/300‑1 (MQ=255) taaATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATANTCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 1:632305/300‑1 (MQ=255) taaATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGTCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 1:378747/300‑1 (MQ=255) taaATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTAc < 2:19028/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTT‑ATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 1:128488/300‑1 (MQ=255) aaTCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAAATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 2:466566/300‑1 (MQ=255) ggtcaagcgtagggaAGCTAAGGTCTACTCTAAAGAAATTAATATATGGCGCTATTATTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTTGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAATATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCGGAGCGAAATTTGAGTCAGCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATTGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAg < 2:169064/287‑1 (MQ=255) aTCAAGTTT‑ATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGt < 2:481603/300‑1 (MQ=255) cAAGTTT‑ATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATTGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTcc < 2:883017/300‑1 (MQ=255) cAAGTTT‑ATAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTcc < 2:252441/300‑1 (MQ=255) cAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAANGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACNTGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTcc < 2:714537/300‑1 (MQ=255) tt‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGaaa < 1:61787/300‑1 (MQ=255) ttatagaAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTAGAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGaaa < 2:395887/296‑1 (MQ=255) gCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATNGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTNATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGt > 2:631163/1‑300 (MQ=255) tcgactctAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAg < 2:329689/296‑1 (MQ=255) tCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAg < 1:3261/300‑1 (MQ=255) gCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCt > 1:493489/1‑300 (MQ=255) tctAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGc < 1:12207/300‑1 (MQ=255) ggCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAAtt < 2:815597/300‑1 (MQ=255) cgcTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTgg > 1:681307/1‑300 (MQ=255) aCTTTATAAAGATTCACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATc < 2:180362/300‑1 (MQ=255) tatcTCATCCATGTATGCCATG‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTTTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCANTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTaagca < 2:217779/297‑4 (MQ=255) tACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATGTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAGTTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCa < 2:349673/300‑1 (MQ=255) aCCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATNTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCAc < 2:223799/300‑1 (MQ=255) cAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATa > 1:261930/1‑300 (MQ=255) gCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATAcc > 1:705726/1‑300 (MQ=255) gCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTAATCTTTAATCACGATAcc > 2:117519/1‑300 (MQ=255) gCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCACCGAGAATACAATTATCCAAAAGTATTTTTTCAATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATCACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCCACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCCTTAATCCCGATAcc > 2:356203/1‑300 (MQ=255) aTGTATGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAAACTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCttt > 1:335035/1‑300 (MQ=255) aTGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATACATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAgg < 2:433362/300‑1 (MQ=255) tGCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGc < 1:169175/300‑1 (MQ=255) gCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCGAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCt < 2:346500/300‑1 (MQ=255) gCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTTAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCt < 1:239796/300‑1 (MQ=255) gCCATA‑TAAA‑A‑AATTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCt < 1:87226/300‑1 (MQ=255) tataaaa‑a‑a‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAgg < 2:326585/296‑1 (MQ=255) | CAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACGTATTTGTTAACCGCGTAAAAAAGAGTTTGCTATCAATTAAGTTTATATTCTGGAGGGTTGCTTTATTCAGGTTGACACGAGACAGATCAGCATGTTCAAAGTTAATTAAATCAAGTTT‑AGAGAAGCTAAGGTCGGCTCTAAATAAATTAATATATGGCGCTATTACTTTATAAAGATTTACCTCAGCCATGTATGCCATA‑TAAA‑A‑A‑TTTGAATAATCAAGGAAGGTATTTTTAATATTGGCTCTATTCATTGTTGCATTGTAGAATTGAACATGCATAGCGGAACATGAATTTAGAGTTCCGTCAGTCATTTTTATCTGAGCGAAATTTGAGTCATCGAGAATACAATTATCAAAAAGTATTTTTTCCATTATGGCGAAATTAAAATTCGTTTTATACATATTACAGTCCTGAAAAATAGCGTTTTGTAGTCTGCAACCTGCAAAATTCGAATTGGATAAATCTTCATCTTTAATCACGATACCTTTCAGGCTAAGG > NC_000913/4282034‑4282623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |