| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 144,375 | C→A | P225Q (CCG→CAG) | yadH → | putative ABC transporter membrane subunit YadH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 144,375 | 0 | C | A | 99.2% | 467.6 / NA | 130 | P225Q (CCG→CAG) | yadH | putative ABC transporter membrane subunit YadH |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
ATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTGCGGGTTTGCTGAACGGTGTGTTTGCCAAAACGTTCGATGACATCAGCCTGGTGCCAACCTTTGTGTTAACGCCACTCACGTATTTGGGCGGGGTCTTTTACTCACTGACTTTGTTGCCGCCGTTCTGGCAAGGGCTGTCGCACCTGAACCCAATCGTTTATATGATCAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCACTTCTTCAGTGC > NC_000913/144080‑144666 | aCTGTTTTGTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTGCGGGTTTGCTGAACGGTGTGTTTGCCAAAACGTTCGATGACATCAGCCTGGTGCCAACCTTTGTGTTAACGCCACTCACGTATTTGGGCGGGGTCTTTTACTCACTGACTTTGTTGCCGCCGTTCTGGCAAGGGCTGTCGCACCTGAACCCAATCGTTTATATGATTAGTGGTGTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCAGCTGGTCAc < 1:746515/300‑1 (MQ=255) 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cAATGATGTTCAGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATCGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTNTTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATNGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCACTTCTTCAg < 2:595956/300‑1 (MQ=255) tgatgTTCAGTTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGGCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGTAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCACTTCTTCAGTGc < 2:87831/300‑1 (MQ=255) tgatgTTCAGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTGTTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCACTTCTTCAGTGc < 1:358846/300‑1 (MQ=255) | ATTTCACTGTTTTTTGTGCCATTTCAGGTGCATTCGTGGGTATTCGTTGCCTTAACGCTGGTGCTCACGGCGGTGTTGTTCTCCCTTGCGGGTTTGCTGAACGGTGTGTTTGCCAAAACGTTCGATGACATCAGCCTGGTGCCAACCTTTGTGTTAACGCCACTCACGTATTTGGGCGGGGTCTTTTACTCACTGACTTTGTTGCCGCCGTTCTGGCAAGGGCTGTCGCACCTGAACCCAATCGTTTATATGATCAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCACTTCTTCAGTGC > NC_000913/144080‑144666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |