| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 101,721 | A→G | E319E (GAA→GAG) | murC → | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 101,721 | 0 | A | G | 98.6% | 253.0 / NA | 71 | E319E (GAA→GAG) | murC | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (35/34); total (35/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGGCGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGCATTGACGACGAGGCTATTTTGCGGGCGCTTGAAAGCTTCCAGGGGACTGGTCGCCGTTTTGATTTCCTCGGTGAATTCCCGCTGGAGCCAGTGAATGGTAAAAGCGGTACGGCAATGCTGGTCGATGACTACGGCCACCACCCGACGGAAGTGGACGCCACCATTAAAGCGGCGCGCGCAGGCTGGCCGGATAAAAACCTGGTAATGCTGTTTCAGCCGCACCGTTTTACCCGTACGCGCGACCTGTATGATGATTTCGCCAATGTGCTGACGCAGGTTGATACCCTGTTGATGCTGGAAGTGTATCCGGCTGGCGAAGCGCCA > NC_000913/101432‑102012 | tttACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGAATTGATGACGAGGCTATTTTACGTGCGCTGGAGAGCTTCCAgg < 1:595663/300‑1 (MQ=255) tACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGAATTGATGACGAGGCTATTTTACGTGCGCTGGAGAGCTTCCAgggg < 1:678379/300‑1 (MQ=255) cGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGAATTGATGACGAGGCTATTTTACGTGCGCTGGAGAGCTTCCAGGGGAc < 1:356972/300‑1 (MQ=255) cGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTAGCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGAATTGATGACGAGGCTATTTTACGTGCGCTGGAGAGCTTCCAGGGGAc < 2:630568/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |