| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 101,496 | G→A | G244G (GGG→GGA) | murC → | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 101,496 | 0 | G | A | 98.7% | 261.6 / ‑6.5 | 75 | G244G (GGG→GGA) | murC | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (37/37); minor base C (1/0); total (38/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
ACCCAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCGTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGGCGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGCATTGACGACGAGGCTATTTTGCGGGCGCTTGAAAGCTTCCAGGGGACTGGTCGCCGTTTTGATTTCCTCGGTGAATTCCCGCTGGAGCCA > NC_000913/101204‑101778 | aCCCAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCCCAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGa > 2:233831/1‑300 (MQ=255)aCCCAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGa > 1:273020/1‑300 (MQ=255) ccAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTNCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGNCTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGAcc < 2:588695/300‑1 (MQ=255) ccAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGAcc < 1:351651/300‑1 (MQ=255) ttAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCTAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACg < 2:87966/300‑1 (MQ=255) aaCGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGc < 1:69034/300‑1 (MQ=255) ggCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCg < 1:249287/300‑1 (MQ=255) aGCGGCNGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCNGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGa < 2:619358/300‑1 (MQ=255) ttCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTag < 1:76131/300‑1 (MQ=255) tCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTaga < 1:203466/300‑1 (MQ=255) 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gTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGCCGTCAGACCACGAATTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGcc > 2:240635/1‑300 (MQ=255) gTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGcc > 1:257686/1‑300 (MQ=255) tCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGccc < 1:58071/300‑1 (MQ=255) 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atatCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCAAGGTCGTCATAAcg > 1:618091/1‑300 (MQ=255) tatCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTCATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACACTGAATGCGCCAGGTCGTCATAAcgc > 2:195191/1‑300 (MQ=255) gCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCTTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCATGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAAc < 2:247910/300‑1 (MQ=255) 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tCCGCGAATTGTTACCGCGAGTTGGACGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGNTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCNCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGAATTGATGACGAGGCTATTTTACGTGCGCTGGAGAGCTTCCAGGGGACTGGGCGCCGTTTTGATTTCCTCGGTGAATTCCCGc < 2:596274/300‑1 (MQ=255) ttGTTACCGCGAGTGGGACTTCCGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTAAGGAAGAGGGAATTGATGACGAGGCTATTTTACGTGCGCTGGAGAGCTTCCAGGGGACTGGGCGCAGTTTTGATTTCCTCGGTGAATTCCCGCTGGAGCCa > 1:600304/1‑300 (MQ=255) | ACCCAACCTTCGTTAACGGCGGGCTGGTAAAAGCGGCGGGGGTTCATGCGCGTTTGGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGCAACCGATGGTGGCGATTGTCACCAATATCGAAGCCGACCACATGGATACCTACCAGGGCGACTTTGAGAATTTAAAACAGACTTTTATTAATTTTCTGCACAACCTGCCGTTTTACGGTCGTGCGGTGATGTGTGTTGATGATCCGGTGATCCGCGAATTGTTACCGCGAGTGGGGCGTCAGACCACGACTTACGGCTTCAGCGAAGATGCCGACGTGCGTGTAGAAGATTATCAGCAGATTGGCCCGCAGGGGCACTTTACGCTGCTGCGCCAGGACAAAGAGCCGATGCGCGTCACCCTGAATGCGCCAGGTCGTCATAACGCGCTGAACGCCGCAGCTGCGGTTGCGGTTGCTACGGAAGAGGGCATTGACGACGAGGCTATTTTGCGGGCGCTTGAAAGCTTCCAGGGGACTGGTCGCCGTTTTGATTTCCTCGGTGAATTCCCGCTGGAGCCA > NC_000913/101204‑101778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |