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Only 100 of 1159 total aligned reads displayed.
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ggTCAGTACAatcctaatagcgccgcactctgggctatcgcccggttgacatgccccgcgccaatcaacaccagacgtggacgcataccatggacgctgataaatactgacattgcacctccacaatctgacccgacagcatccgcaccgtgacgagccatacgtccatggaataatcgcggcttacgttcctgcaatgcctgaagcgactcttcaatcaccttccgctcaaccattccgccaccaactgtaccgacgatagaaccagcggcgcgcactaacatgtgtgcagaatggcgg > 1:476546‑M2/1‑10 (MQ=255) gTCAGTACAcaaacgggcttttctccgggactaccgaactccacggcgtcacggncataatcacaatcagcgcgaagacgtagaacataatgatacggatcggaatggagttaatcgcgcgtggcagtgatttctctggatctttggtttccgcagctgttgtacctaccagctcaatccccacgaaagcgaaaaccgctatctggaatccggcaaagaagccacttaaacctttcgggaaccngccgccgtcattccacaaatgcgcgaatgacgcttccacaccagtcggtgactgaa < 2:698353‑M1/300‑292 (MQ=255) gTCAGTACAaaccgaggccaaagaatgaacctagcaattcagatcttagcctcttacccgccatccggcaaggagaaaggctatgaagcacaaccctctggtggtgtgtctgctcattatctgcattacgattctgacattcacactcctgacccgacaaacgctctacgaactgcggttccgggacggtgataaggaggttgctgcgctcatggcctgcacgtccaggtaagggcaagcgcggggattttccccgcgcatttgactagcagattcattttctcatggcaccccttttac > 1:228840‑M2/1‑9 (MQ=255) aGTACAccctggggctgccactccaaacccgaacaatttggatggtagtcccttcttcgcatggaggcaatataaacatgctgacgaaatatgcccttgcggcagtcatagtgctgtgtttaacggtgctgggatttacgcttctggtcggagactcgctgtgtgagtttacggtgaaggaacgtaatattgagtttaaggctgttctcgcttacgaaccgaagaagtagccgttgtgcggggagtaatcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac < 2:243176‑M2/300‑295 (MQ=255) gTACAcaaacgggcttttctacgggactaccgaactccacggcgtcacggacataatcacaatcagcgcgaagacgtagaacataatgatacggatcggaatggagttaatcgcgcgtggcagtgatttctctggatctttggtttccgcagctgttgtacctaccagctcaatccccacgaaagcgaaaaccgctatctggaatccggcaaagaagccacttaaacctttcgggaaccagccgccgtcattccccaaatgcgcgaatgacgcttccacaccagtcggtgaatgaaagtg > 2:1185‑M1/1‑5 (MQ=255) gTACAaaccgaggccaacgaatgaacctagcaattcagatcttagcctcttacccgccatccggcaaggagaaaggctatgaagcacaaccctctggtggtgtgtctgctcattatctgcattacgattctgacattcacactcctgacccgacaaacgctctacgaactgcggttccgggacggtgataaggaggttgctgcgctcatggcctgcacgtccaggtaagggcaagcgcggggattttccccgcgcatttgactagcagattcattttctcatggcaccccttttacactt < 1:14384‑M2/300‑296 (MQ=255) | TCGTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTCG > NC_000913/3721776‑3722370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |