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* | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 91 (0.960) | 59/598 | 0.3 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
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GGACAGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACA‑GGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTC > NC_000913/3185797‑3186391 | ggACAGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGttatt > 2:49483/1‑300 (MQ=255) 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ttattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATCGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACA‑GGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 1:728576/1‑300 (MQ=14) ttattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTCATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGACCAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACA‑GGAAAAGATCGAAATTACTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTACCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGACAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCAGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 1:711050/1‑300 (MQ=11) ttattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACA‑GGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 2:19686/1‑300 (MQ=31) | GGACAGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACA‑GGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTC > NC_000913/3185797‑3186391 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |