Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 2,020,325 | IS150 (+) +4 bp | coding (239‑242/1005 nt) | fliM → | flagellar motor switch protein FliM |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 2020325 = | 0 (0.000) | 87 (0.920) | 58/596 | 0.3 | 100% | coding (239/1005 nt) | fliM | flagellar motor switch protein FliM |
? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 2020328 | 0 (0.000) | 116 (1.220) | 77/598 | 0.1 | 100% | coding (242/1005 nt) | fliM | flagellar motor switch protein FliM |
? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
TCAACTTCCAGCGGATTAATCGCCTTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2020619‑2020325 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 TCAACTTCCAGCGGATTAATCGCCTTCCAGGCGTCGCTATAGCCTTCAAGCGCCAGTTTCAACATGCGGTTGATGACGCGCTGTTCGGTATGGGTAAACTCGCGACCTTCCACTTTGGTCGGGAAGCGTCCATCGCCGCCAAACAGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGGTGTAC < 1:97114/300‑1 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AGGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCT > 1:302436/1‑300 GGTTATCCACGGCGATAAACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCTGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTT > 1:571981/1‑300 ACACCAGACTCGGTGAGAACACCACCAGCCCAGTGCCGCGCAGCGGTTTCAGATGGATAAGGTTCAGGTTGGTCGGCACCGGCAGGTTGCGGGCAAATTCATGGTACGGCTGAATGCGGATGGCCCCGACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCA > 1:4012/1‑300 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ACGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCAT > 1:126507/1‑300 CGGTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < 1:672233/300‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |