| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,631,478 | IS2 (+) +5 bp | coding (804‑808/1284 nt) | ydfJ ← | putative transporter YdfJ |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | 168 (1.760) | 106/598 | 0.0 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1631478 = | 0 (0.000) | coding (808/1284 nt) | ydfJ | putative transporter YdfJ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 94 (0.990) | 61/598 | 0.3 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1631482 | 0 (0.000) | coding (804/1284 nt) | ydfJ | putative transporter YdfJ | |||||
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1468944‑1469240‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGGTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTCCGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCCGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCGCTTCCGGTTTTGGTCCTATCCTGGCGGGT < NC_000913/1631482‑1631188 GGAACAACCTGTTCTCCTGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCATAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGNGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCNGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCT < 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TATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGGTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTCCGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCCGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCG < 1:427141/300‑1 GGGGGCCAGTCTACCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGTTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTCCGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCCGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCGCTTCCGGTTTTGGTCCTATCC < 1:80709/300‑1 GGGGGCCAGTCTACCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGGTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTCCGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCCGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCGCTTCCGGTTTTGGTCCTATCC < 1:566184/300‑1 GCCAGTCTACCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGGTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTCCGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCCGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCGCTTCCGGTTTTGGTCCTATCCTGGC < 1:423211/300‑1 AGTCTACCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGGTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTCCGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCCGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCGCTTCCGGTTTTGGTCCTATCCTGGCGGG > 1:211694/1‑300 GTCTACCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGGTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTACGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCAGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCGCTTCCGGTTTTGGTCCTATCCTGGCGGGT > 2:354025/1‑300 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NC_000913/1468944‑1469240‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTTGGTTGGTTATCCGATAAAATTGGTCGCCGGATCCCGTATATTATTATGAATACCTCCGCGATTGTGCTGGCATGGCCAATGCTTTCTATCATTGTAGATAAAAGCTATGCCCCGAGCACCATTATGGTTGCACTGATTGTGATTCATAACTGTGCGGTGCTGGGATTATTTGCTCTGGAAAACATTACCATGGCAGAAATGTTCGGCTGTAAAAACCGCTTTACCCGGATGGCTATTTCTAAAGAAATTGGTGGTCTTATCGCTTCCGGTTTTGGTCCTATCCTGGCGGGT < NC_000913/1631482‑1631188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |