| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 578,072 | IS2 (+) +5 bp | coding (460‑464/498 nt) | rrrD → | lysozyme |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 99 (1.040) | 67/596 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 75 (0.790) | 58/598 | 0.3 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 578072 = | 0 (0.000) | coding (460/498 nt) | rrrD | lysozyme | |||||
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381556‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aATCTCACGACGAGTCATCAGGCCTTTCCATTGCTTACCGCCAGCGTATGTCCAGCGACGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTC < NC_000913/578076‑577782 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGGTATTGGTTGTATGGAGATTCAGGGGGCCAGCCTAATC > 2:357549/1‑300GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATC < 1:46055/300‑1 GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTTGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATCT < 1:315113/300‑1 GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATCT < 1:128329/300‑1 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TGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATCTCACGACGAGTCATCAGGCCTTTCCATTGCTTACCGCCAGCGTATGTCCAGCGACGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTAC < 1:298834/300‑1 gCAGGGGGCCAGTCTAATCTCACGACGAGTCATCAGGCCTTTCCATTGCTTACCGCCAGCGTATGTCCAGCGACGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCAT < 1:591983/299‑1 GGGCCAGTCTAATCTCACGACGAGTCATCAGGCCTTTCCATTGCTTACCGCCAGCGTATGTCCAGCGACGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCNGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGT > 1:498157/1‑300 AGTCTAATCTCACGACGAGTCATCAGGCCTTTCCATTGCTTACCGCCAGCGTATGTCCAGCGACGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTT > 2:480094/1‑300 GTCTAATCTCACGACGAGTCATCAGGCCTTTCCATTGCTTACCGCCAGCGTATGTCCAGCGACGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTC > 1:360907/1‑300 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381556‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aATCTCACGACGAGTCATCAGGCCTTTCCATTGCTTACCGCCAGCGTATGTCCAGCGACGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTC < NC_000913/578076‑577782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |