Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,128,813 | Δ2 bp | coding (142‑143/1161 nt) | metB → | O‑succinylhomoserine(thiol)‑lyase/O‑ succinylhomoserine lyase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,128,811 | 0 | C | . | 98.0% | 496.4 / 3.0 | 100 | coding (140/1161 nt) | metB | O‑succinylhomoserine(thiol)‑lyase/O‑ succinylhomoserine lyase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,128,812 | 0 | G | . | 100.0% | 513.2 / NA | 99 | coding (141/1161 nt) | metB | O‑succinylhomoserine(thiol)‑lyase/O‑ succinylhomoserine lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (46/53); total (46/53) |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
ACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACTCGCGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAACTGGTACTGGTAGAAAG > NC_000913/4128512‑4129105 || aCCTGTCGGCTTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCATGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACtc < 2:356627/300‑1 (MQ=255) 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ttAATGAACCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCNCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGANTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAAccc > 2:530748/1‑300 (MQ=255) aaCCGCGCGCGCATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCAAAactg > 2:629945/1‑300 (MQ=255) gcgcgcgcATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAactggtac < 2:268967/300‑1 (MQ=255) gcgcgcgcATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGGTCAGCTGGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGACATGTCCGCGATCCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGTGAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAactggtac < 1:489575/300‑1 (MQ=255) gcgcgcAGGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAAGACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTACTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAactggtactg < 2:22510/300‑1 (MQ=255) gcgcATGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATNTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACNGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAactggtactggt < 2:497017/300‑1 (MQ=255) aTGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCANAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGTCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCNATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAACTGGTACTGGTAGaa < 2:694351/300‑1 (MQ=255) aTGATTACT‑‑CGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAACTGGTACTGGTAGaa < 2:575138/300‑1 (MQ=255) gattacgcggcgcggCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGTGAACGATCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAACTGGTACTGGTAGAAAg < 2:48552/295‑1 (MQ=255) || ACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATGTCCAGATGTATTGACGTCCATTAACACAATGTTTACTCTGGTGCCTGACATTTCACCGACAAAGCCCAGGGAACTTCATCACATGACGCGTAAACAGGCCACCATCGCAGTGCGTAGCGGGTTAAATGACGACGAACAGTATGGTTGCGTTGTCCCACCGATCCATCTTTCCAGCACCTATAACTTTACCGGATTTAATGAACCGCGCGCGCATGATTACTCGCGTCGCGGCAACCCAACGCGCGATGTGGTTCAGCGTGCGCTGGCAGAACTGGAAGGTGGTGCTGGTGCAGTACTTACTAATACCGGCATGTCCGCGATTCACCTGGTAACGACCGTCTTTTTGAAACCTGGCGATCTGCTGGTTGCGCCGCACGACTGCTACGGCGGTAGCTATCGCCTGTTCGACAGTCTGGCGAAACGCGGTTGCTATCGCGTGTTGTTTGTTGATCAAGGCGATGAACAGGCATTACGGGCAGCGCTGGCAGAAAAACCCAAACTGGTACTGGTAGAAAG > NC_000913/4128512‑4129105 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |