Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 57,276 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑167/‑84) | lptD ← / → djlA | lipopolysaccharide assembly protein LptD/co‑chaperone protein DjlA |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 57280 | 0 (0.000) | 98 (1.110) | 71/598 | 0.1 | 100% | intergenic (‑171/‑84) | lptD/djlA | lipopolysaccharide assembly protein LptD/co‑chaperone protein DjlA |
? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GTACCAGAGGACGGTCATAGCTTGGCACGCCCAACATGCACTGTGAGGCGAGGTCGGCTGCCAGTCCCTGTTGACTATAAAGGGCGGTGGCAATCATGGTGGCCAGGAGAGTGGGGATACGTTTTTTCATACGTTGATTTTATTGTTCCATCATCGGTAACGTTGCGCGTGACAAACGGTCAGAGACTAACGTACTCGTCATCTCTACGCTAGTGTTAATCCTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAATTATAGGCGATGTCCCACAATTGACCGCAGCCGGAAAACGGTAAAAGCACCTTTATATTGTGGGAGATAGCCCTGATATCCGTGTGTCGATTTGGGGAATATATGCAGTATTGGGGAAAAATCATTGGCGTGGCCGTGGCCTTACTGATGGGCGGCGGCTTTTGGGGCGTAGTGTTAGGCCTGTTAATTGGCCATATGTTTGATAAAGCCCGTAGCCGTAAAATGGCGTGGTTCGCCAACCAGCGTGAGCGTCAGGCGCTGTTTTTTGCCACCACTTTTGAAGTGATGGGGCATTTAACCAAATCCAAAGGTC > NC_000913/56980‑57574 | gTACCAGAGGACGGTCATAGCTTGGCACGCCNAACATGCACTGTGAGGCGAGGTCGGCTGCCAGTCCCTGTTGACTATAAAGGGCGGTGGCAATCATGGTGGCCAGGAGAGTGGGGATACGTTTNTTCATACGTTGATTTTATTGTTCCATCATCGGTAACGTTGCGCGTGACAAACGGTCAGAGACTAACGTACTCGTCATCTCTACGCTAGTGTTAATCCTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAATTATAGGCGATGTCCcac > 2:515159/1‑300 (MQ=255) 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acacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccaagggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCCACAATTGACCGCAGCCGGAAAACGGTAAAAGCACCTTTatat < 1:355611‑M1/44‑1 (MQ=255) acacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaaagataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCCACAATTGACCGCAGCCGGAAAACGGTAAAAGCACCTTTatat > 2:681724‑M1/257‑300 (MQ=255) acggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCCACAATTGACCGCAGCCGGAAAACGGTAAAAGCACCTTTATATtg > 1:113701‑M1/255‑300 (MQ=255) 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GTACCAGAGGACGGTCATAGCTTGGCACGCCCAACATGCACTGTGAGGCGAGGTCGGCTGCCAGTCCCTGTTGACTATAAAGGGCGGTGGCAATCATGGTGGCCAGGAGAGTGGGGATACGTTTTTTCATACGTTGATTTTATTGTTCCATCATCGGTAACGTTGCGCGTGACAAACGGTCAGAGACTAACGTACTCGTCATCTCTACGCTAGTGTTAATCCTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAATTATAGGCGATGTCCCACAATTGACCGCAGCCGGAAAACGGTAAAAGCACCTTTATATTGTGGGAGATAGCCCTGATATCCGTGTGTCGATTTGGGGAATATATGCAGTATTGGGGAAAAATCATTGGCGTGGCCGTGGCCTTACTGATGGGCGGCGGCTTTTGGGGCGTAGTGTTAGGCCTGTTAATTGGCCATATGTTTGATAAAGCCCGTAGCCGTAAAATGGCGTGGTTCGCCAACCAGCGTGAGCGTCAGGCGCTGTTTTTTGCCACCACTTTTGAAGTGATGGGGCATTTAACCAAATCCAAAGGTC > NC_000913/56980‑57574 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |