| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,991,812 | C→T | noncoding (3/67 nt) | 3'ETS‑leuZ ← | small regulatory RNA 3'ETSleuZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,991,812 | 0 | C | T | 98.9% | 315.1 / ‑6.2 | 90 | noncoding (3/67 nt) | 3'ETS‑leuZ | small regulatory RNA 3'ETSleuZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (41/48); minor base G (0/1); total (41/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTCCAGCTCCGCCACATCAAGGATGGCGTGGTCAGTGTTGTATTTGGTCAGAATATCGTCCAGCCATTCCAACTCACTTTCGTTTAACGGTCCCGTTTTCATACGCTTTTCCTTGTGGATCTCAACTCGCCAGCACCTATCTTACATGCCGGTCCGTATCAGAGATACTTTTTGAGTGGCTTTGCTGGTGATTAAAAATTAAGGAGGGTGTAACGACAAGTTGCAGGCACAAAAAAACCACCCGAAGGTGGTTTCACGACACTGCTTATTGCTTTGATTTTATTCTTATCTTTCCCATGGTACCCGGAGCGGGACTTGAACCCGCACAGCGCGAACGCCGAGGGATTTTAAATCCCTTGTGTCTACCGATTCCACCATCCGGGCTCGGGAAGAAAGTGGAGGCGCGTTCCGGAGTCGAACCGGACTAGACGGATTTGCAATCCGCTACATAACCGCTTTGTTAACGCGCCAAATTCTTCAGGCCTTTCAGCCAGACATCCGCTTGACGCCGATGTCTTTTAAACTGGAGCGGGAAACGAGACTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTG > NC_000913/1991517‑1992105 | cGTCCAGCTCCGCCACATCAAGGATGGCGTGGTCAGTGTTGTATTTGTTCAGAATATCGTCCAGCCATTCCAACTCACTTTCCTTTAACGGTCCCGTTTTCATACGCTTTTCCTTGTGGATCTCAACTCGCCAGCACCTATCTTACATGCCGGTCCGTATCAGAGATACTTTTTGAGTGGCTTTGCTGGTGATTAAAAATTAAGGAGGGTGTAACGACAAGTTGCAGGCACAAAAAAACCACCCGAAGGTGGTTTCACGACACTGCTTATTGCTTTGATTTTATTCTTATCTTTCTCATg < 2:748879/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |