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tCCTCTNTGAGTCAAAAtggccccattgtcttgtatttatttgtttttttaactntattatcaataagttaaatcaaacctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactggcggtataacgcacagtatggcgaatatttcgatgccctagataatcctgaattaaacgagtatctgcaccacgctccgccaattcataaccgcaagcatgccttaacatatgaggatgagtctgcgttacggttccagcttcaatac > 2:719074‑M2/1‑17 (MQ=255) tCCTCTATGAGTCAAAAtggccccattgtcttgtatttatttgtttttttaactttattatcaataagttaaatcaaacctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactggcggtataacgcacagtatggcgaatatttcgatgccctagataatcctgaattaaacgagtatctgcaccacgctccgccaattcataaccgcaagcatgccttaacatatgaggatgagtctgcgttacggttccagcttcaatac > 1:1181‑M2/1‑17 (MQ=255) tctATGAGTCAAAAtggccccattgtcttgtatttatttgtttttttaactttattatcaataagttaaatcaaacctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactggcggtataacgcacagtatggcgaatatttcgatgcccgagataatcctgaattaaacgagtatctgcaccacgctccgccaattcataaccgcaagcatgccttaacatatgaggatgagtctgcgttacggttccagcttcaataccgg > 1:219139‑M2/1‑14 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |