| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,291,527 | IS2 (–) +5 bp | coding (187‑191/1092 nt) | yraK → | putative fimbrial adhesin YraK |
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| * | ? | NC_000913 | 3291527 = | 0 (0.000) | 126 (1.160) | 76/598 | 0.1 | 100% | coding (187/1092 nt) | yraK | putative fimbrial adhesin YraK |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACNCCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCCTTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGTTTGTCGGTCCTGcat > 2:219502/1‑297 TAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTTAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAATAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATC < 1:478991/300‑1 GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGT > 2:782775/1‑300 GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGAATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTG > 2:853255/1‑300 TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTGTAC < 1:504279/300‑1 AGTGGTAACAGATGTCTGGAAATATATGGGCAAACCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACGGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTGTACTG < 2:115631/300‑1 AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATACGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAAGTTCTGAATCCGGTGTACTG > 1:233800/1‑300 AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTGTACTG > 1:290310/1‑300 GGGGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTGTACTGAAAGCAAACTGACATTGTTGATCTGC > 1:272014/1‑300 GGCAAATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTACCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCATGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTACTGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGCGTACTGAAAGCAAACTGACATTGTTGATCTGCat > 2:383261/1‑298 ATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTGTACTGAAAGCAAACTGACATTGTTGATCTGCCTGATTT < 2:672074/300‑1 ATCCAGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTACTGAGGAGGCATAAGCGCCGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCATTAATGGCCCTGCACTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTGTACTGAAAGCAAACTGACATTGTTGATCTGCCTGATTT > 2:297829/1‑300 AACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2996657‑2996361‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGTGCTACTTAGCGTTGCAGAGGTAAACTCCCGTCCTGTCACGTTATCTGTCTGGTTCACCGTAACATCATCAACCACACTGCTGTAATTTGTCGCACCGCTAGTGCTGTCGGCTCCACACCCTCCTGAGGAGGCATAAGCGCAGGATGTGGATATCAACAAAAGACCTGTTATAAGAGGCGCTCTTTTCATTTTTTTATCCTTAATGGCACTGCGCTGTGCCTTGTAATACAGAGGTTGTAGGTTCTGAATCCGGTGTACTGAAAGCAAACTGACATTGTTGATCTGCCTGATTT < NC_000913/3291531‑3291237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |