Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,813,272 | 0 | C | T | 32.0% | 145.0 / 40.3 | 101 | S181L (TCG→TTG) | dfp | fused 4'‑phosphopantothenoylcysteine decarboxylase and phosphopantothenoylcysteine synthetase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-17 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CCGGAATGGCGAATGACCTGGTATCGACGATTTG‑TCTGGCTACACCTGCGCCTGTAG‑CCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCG‑CATTTTTCGCCC‑GTCAACGA‑CCTGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCC‑GGCCCGACGCGTG‑AACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGG‑CAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTT‑AAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCT > NC_000913/3813029‑3813519 | gtggAAGGGCGAATGCCCTGGTATCG‑CGGTTTGGTCTGGCTCCCCCGGCGCCTGGAG‑CCGTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCG‑CATTTTTCGCCC‑GTc < 2:682737/249‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |