Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 263050 | 388707 | 125658 | 21 [19] | [20] 21 | ykfI–tauD | ykfI,yafW,ykfH,ykfG,yafX,ykfF,ykfB,yafY,yafZ,ykfA,perR,insN,insI1,insN,eyeA,ykfC,insH1,mmuP,mmuM,afuC,insB2,insA2,yagB,yagA,yagE,yagF,yagG,yagH,xynR,argF,argL,ykgS,insB3,insA3,yagJ,yagK,yagL,yagM,ykgV,yagN,intF,yagP,paoD,paoC,paoB,paoA,yagU,ykgJ,ecpE,ecpD,ecpC,ecpB,ecpA,matA,ykgL,ykgO,ykgM,ykgR,insE1,insF1,rclC,rclB,rclA,rclR,ykgE,ykgF,ykgG,ykgH,betA,betB,betI,betT,yahV,pdeL,yahB,yahC,yahD,yahE,yahF,yahG,yahH,yahI,yahJ,yahK,yahL,yahM,yahN,yahO,prpR,prpB,prpC,prpD,prpE,codB,codA,cynR,cynT,cynS,cynX,lacA,lacY,lacZ,lacI,mhpR,mhpA,mhpB,mhpC,mhpD,mhpF,mhpE,mhpT,yaiL,frmB,frmA,frmR,yaiO,yaiX,insC1,insD1,yaiX,yaiP,ykiC,yaiS,tauA,tauB,tauC,tauD |
CATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACAT > NC_000913/262800‑263093 | cATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTac > 1:580385/1‑250 (MQ=255) tGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGATGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTacct > 2:103253/1‑247 (MQ=255) gCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCACGGCCGATATAGCTCAGTTGCTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGCCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTg > 1:470785/1‑250 (MQ=255) aTCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGAcc < 2:39110/251‑1 (MQ=255) cccGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCaaa > 1:541311/1‑250 (MQ=255) cccGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCaaa > 1:581161/1‑250 (MQ=255) ccGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCaaaa > 1:354963/1‑250 (MQ=255) aaCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAgga < 2:580385/251‑2 (MQ=255) aaCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAA‑TTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAggat < 1:11933/251‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTTAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAggat < 2:210070/251‑3 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGa < 2:424107/231‑1 (MQ=255) aCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGAAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGa > 1:424107/1‑231 (MQ=255) ttGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGAt > 1:19933/1‑243 (MQ=255) ttGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGAt < 2:19933/243‑1 (MQ=255) tGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAggataaa < 1:126664/250‑6 (MQ=255) aCCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAggataaatctcg > 1:150504/1‑240 (MQ=255) ccGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAggataaatctcga > 2:380906/1‑239 (MQ=255) ttCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAggataaatctcgaaaataat > 1:231966/1‑233 (MQ=255) cACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAggataaatctcgaaaataat > 2:624287/1‑231 (MQ=255) tCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATa < 2:343936/208‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTACCTACTGACCAAAAAGGCCTGATa > 1:343936/1‑208 (MQ=255) | CATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACAT > NC_000913/262800‑263093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |