| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,449,779 | G→A | S35S (AGC→AGT) | rpsC ← | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,449,779 | 0 | G | A | 99.0% | 349.9 / NA | 101 | S35S (AGC→AGT) | rpsC | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (40/60); total (40/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GCAACCAGTTTTGCGTCCAGTTCAGGCTTACGAACTTCGGCGATGTTGATCTGTGCAGGAACGCCAGCGATGTCCGCTACGACCTTACGCAGTTTTTCTACGTCTTCACCTTTTTTACCGATAACGATACCCGGGCGAGCAGTGTGAATGGTTACACGGATGCTCTTAGCCGGACGCTCGATAACGATACGAGATACGGACGCTTTAGCCAGTTCCTTAGTCAGGTACTGACGTACTTTAAAATCGCTGTCCAGGTTGTCAGCGAATTCTTTGGTGTTCGCAAACCAGGTAGAGTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTT > NC_000913/3449534‑3450025 | gCAACCAGTTTTGCGTCCAGTTCAGGCTTACGAACTTCGGCGATGTTGATCTGTGCAGGAACGCCAGCGATGTCCGCTACGACCTTACGCAGTTTTTCTACGTCTTCACCTTTTTTACCGATAACGATACCCGGGCGAGCAGTGTGAATGGTTACACGGATGCTCTTAGCCGGACGCTCGATAACGATACGAGATACGGACGCTTTAGCCAGTTCCTTAGTCAGGTACTGACGTACTTTAAAATCACTGTc < 2:102977/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |