New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 806457 | 57 (1.020) | 3 (0.050) | 3/490 | 3.6 | 5.0% | coding (825/1284 nt) | ybhC | outer membrane lipoprotein YbhC |
? | NC_000913 | = 4037143 | 56 (1.010) | noncoding (3/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTG > NC_000913/4036901‑4037341 | gTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACTCCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGc < 1:59677/251‑1 (MQ=18) gAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTc < 1:94339/251‑1 (MQ=33) gTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAggtgg > 1:150640/1‑251 (MQ=33) cccGGGCCTTGTCCACACCACCCGTCCCACCCTGGGAGCGGGTTGCAAAAGCAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGCGATTCATGACTGGGGGGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACATGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACATCTACAGGATTGTAGCACAGGTGGttt > 2:265874/1‑250 (MQ=11) cGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTGGCAAAAGAAGTAGGTAGCGTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGGAAAACCTCTACAGTCTTGTAGCTCAGGTGGTTag‑a < 2:379151/251‑1 (MQ=16) ggCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACGCA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑Agc < 1:388083/251‑1 (MQ=18) ccacCGCCCGTCCCACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGTTAGCTGAACCTTCGGTAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGGAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACATCCTTACCTTAAAGAATCGTTCGTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGGCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCGACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTGAC‑AGCGCACTCCTGa < 2:293318/250‑1 (MQ=11) cactgCCCGTCACACCATGGGAGTGGGGGTCGAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCAGTGTGTGATTCATGACTGGGGGGAATTGGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCGCCTTACCTTAAAGGAGCGGTCTTTGATGTGCTCGCACA‑GATTGTCTGTTGTAAATGAACGGTAAAGCCTGTACAGGCGTGGAGTTCAGGTG‑TTGGTAGCGCAACCCTGAt < 2:365953/247‑1 (MQ=2) cacCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCGTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTTTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGAt < 2:65056/251‑1 (MQ=18) acCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGCGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTgct > 1:400986/1‑248 (MQ=18) cacCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGTGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTGCCTTAAAGAAGTGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGATCAGTAAAACCGCTACAGGCTGGTATCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTc < 1:263735/251‑1 (MQ=11) acCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCg < 2:41717/251‑1 (MQ=33) gTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCa > 2:241179/1‑250 (MQ=33) gCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCAc < 1:291639/250‑1 (MQ=33) gCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGATTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTGTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAGCCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCAc < 2:224788/250‑1 (MQ=18) aaaGAAGGAGGGAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGATTACCACTGTGTTATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCGCCTTACCGTAAAGAAGCGGTCTTTGAAATGCACACACA‑GAGTGGCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTTCAGTCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGGACCCGTGAGAAAGGTTAGGTCGGTTGTTCAAGTCCGCTCAg < 2:411568/251‑1 (MQ=11) aagTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCt < 1:43125/251‑1 (MQ=33) aggaggtagCGTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTa < 2:150640/248‑1 (MQ=18) gcgcTTACCACTTTGTGCTTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCa > 1:336227/1‑229 (MQ=18) gcgcTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGGGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCa < 2:336227/229‑1 (MQ=18) tACCACTTTGTGCTTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACACGGTCACCGTAGGGGCACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACATTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAACACCTCTACCGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAACTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGtt > 2:50879/1‑251 (MQ=11) tACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCGTGTAGCGCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAgg < 1:118400/249‑1 (MQ=18) cACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑TATTGTCTGATGAAAAGGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTTGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAATTTCACGCAGGCCTACCAAATTGGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTa < 1:382393/251‑1 (MQ=11) cTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAAc > 2:147722/1‑251 (MQ=33) tgtgATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTGCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTGTTAACTa < 2:280175/250‑1 (MQ=18) gtgATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTAc < 1:239626/250‑1 (MQ=33) gATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCTCTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATg < 1:37518/251‑1 (MQ=18) aTTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGt > 1:23820/1‑251 (MQ=33) tCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGtt < 1:130436/250‑1 (MQ=33) cATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTAt < 1:87573/251‑1 (MQ=33) gggTGAATTCGTAACAAGGATACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTTCTTACCTGAAAGAAGGGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAATATTGGCTGTAAAACCTCTGCGGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCTGGTCGCTGATAAGGGTGAGGTCGATGGTGCAATGCCTCTCAGGCCTACTAAGTTTGGACAGCAATTTCGAAGGGGTGGTAACTGTATTTTATGGGGCtat < 2:55539/251‑1 (MQ=2) gTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCtat > 1:116127/1‑249 (MQ=33) tGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGGGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGc > 1:223695/1‑251 (MQ=18) tGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGc > 2:73458/1‑251 (MQ=33) aGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGc < 1:331250/119‑1 (MQ=38) aGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGc > 2:331250/1‑119 (MQ=38) ggTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGTGGAGGTCGGTGGTTCACGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTCTAGCTCAGCTGGGAGAgc > 2:422603/1‑251 (MQ=16) aGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCttt < 1:171838/251‑1 (MQ=33) ccTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGGGAGGTCGGTGGGTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCa < 2:382615/247‑1 (MQ=18) ccTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGCGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCa > 1:382615/1‑247 (MQ=18) gctgTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACCCA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCag < 1:65922/246‑1 (MQ=18) cGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCaggag < 1:146926/251‑1 (MQ=33) cACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGt > 1:424478/1‑251 (MQ=33) cACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GAGTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCGCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGGTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTAGAGCTGAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCgg < 1:190845/250‑1 (MQ=255) cACCTCCTTACCATAAAGAAGCGTTCTTGGAAGTGATCAC‑CACGATTGTCAGATGAAAAGGAGCAGTAACACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGGCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATGTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGTCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCggg < 2:235877/251‑2 (MQ=11) cctcctTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGTTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGATGTTTTAACGACGGGTTATGGGGCGATAGCGCAGCTTGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTc < 1:403580/251‑1 (MQ=11) cctcctTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTc < 1:157171/251‑1 (MQ=33) cctcctTACCTTAAAGAAGCGTTCGTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAGTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTc < 2:296763/251‑1 (MQ=18) taccttaAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATcc < 2:84038/250‑1 (MQ=33) accttaAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATccc < 2:23820/250‑1 (MQ=33) taAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCa < 1:241179/249‑1 (MQ=33) 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ttGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATctct > 1:103820/1‑251 (MQ=31) gAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTg < 1:229377/250‑1 (MQ=11) | GTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACA‑GATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAG‑AGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTG > NC_000913/4036901‑4037341 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |