| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,449,779 | G→A | S35S (AGC→AGT) | rpsC ← | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,449,779 | 0 | G | A | 99.4% | 567.4 / NA | 155 | S35S (AGC→AGT) | rpsC | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (74/80); minor base T (1/0); total (75/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CAGCAACCAGTTTTGCGTCCAGTTCAGGCTTACGAACTTCGGCGATGTTGATCTGTGCAGGAACGCCAGCGATGTCCGCTACGACCTTACGCAGTTTTTCTACGTCTTCACCTTTTTTACCGATAACGATACCCGGGCGAGCAGTGTGAATGGTTACACGGATGCTCTTAGCCGGACGCTCGATAACG‑‑ATACGAGATACGGACGCTTTAGCCAGTTCCTTAGTCAGGTACTGACGTACTTTAAAATCGCTGTCCAGGTTGTCAGCGAATTCTTTGGTGTTCGCAAACCAGGTAGAGTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACT > NC_000913/3449532‑3450024 | ccAGTTTTGCGTCCAGTTCAGGCTTACGAACTTCGGCGATGTTGATCTGTGCAGGAACGCCAGCGATGTCCGCTACGACCTTACGCAGTTTTTCTACGTCTTCACCTTTTTTACCGATAACGATACCCGGGCGAGCAGTGTGAATGGTTACACGGATGCTCTTAGCCGGACGCTCGATAACG‑‑ATACGAAATACGGACGCTTTAGCCAGTTCCTTAGTCAGGTACTGACGTACTTTAAAATCACTGTCCAgg > 2:21031/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |