| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
ATCATGTCGTCGCTTCTCGGCGTCTCCTTCGTTGGCGCATTTCTGGTTGTCGGATCTTCATTTATCTTGCCCTATTTACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGCGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTCGGCTATATCGCATCGTTATGCCTGGGCATGGTGGATTTCAGCAGTATGCGCAATTTGCCGTTAATCACCATCCCGCATCCGTTCAAATACGGCTTTAGTTTTAGCTTCCATCAGTTCCTGGTGGTTGGCACGATTTATCTGCTTAGCGTGCTGGAAGCAGTCGGCGATATCACCGCCACGGCAATGGT > NC_000913/3024699‑3025198 | aTCATGTCGTCGCTTCTCGGCGTCTCCTTCGTTGGCGCATTTCTGGTTGTCGGATCTTCATTTATCTTGCCCTATTTACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGCGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCgg > 1:130842/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |