| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,436,697 | G→A | E60E (GAG→GAA) | trkA → | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,436,697 | 0 | G | A | 99.0% | 329.7 / NA | 102 | E60E (GAG→GAA) | trkA | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (51/50); minor base C (1/0); total (52/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTA‑CAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCC > NC_000913/3436452‑3436937 | gAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTA‑CAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAgg > 1:357965/1‑251 (MQ=255)gAAGAGGGCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTA‑CAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAgg > 2:406540/1‑251 (MQ=255) gggCGACGGCTTCTTTTCCGCTAAGCTAATCAAAAAGTGATGAGATAGCGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGCGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGTACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGCGCGTCTGCGGACGTTA‑CCGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGTCTGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCcg > 1:254303/1‑251 (MQ=255) gCGACGGCTTCTTTTACGCTAAGCTAATCACAAAGTGATGAGATAACGGGTCCCGACTGAAGAAAATTATAATTATCGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCCCACAAGCGGAACACCTCGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACAAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTA‑CAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCcgac > 1:71015/1‑251 (MQ=255) 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gaTAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTA‑CAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTCTTGCGGGAAGCCGGGGCCGACGCTGCCGATATGCGGGTTGCTGTCACCCGTTCAggagaatc > 2:14073/1‑244 (MQ=255) aTAACGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCGGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTA‑CAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAGCCAGTTCAGATGAAAcc < 1:492622/251‑1 (MQ=255) aCGGGTCGCGACTGATGAAAATTATCATTCTGGGTGCCAGCCAGGTTGGCGGCACACTGGCGGAAAACCTGGTTGGCGAGAACAACGATATTACTGTTGTCGATACCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTA‑CAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGCAGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTAAGATGAAACCAat > 2:505061/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |