Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 948,528 | 0 | A | G | 34.2% | 52.2 / 32.5 | 44 | I434V (ATC→GTC) | ycaM | putative transporter YcaM |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (13/14); new base G (7/7); total (23/21) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.28e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAGGACATATACTGGCGG‑TTTGGATAATAGATCTGGAAGCCT > NC_000913/948281‑948774 | ggtggCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGAt < 1:145987/249‑1 (MQ=255) ggCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGAGGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCATAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCGTTGCCGGTTTGACGGGGATCTTcc < 2:391915/251‑1 (MQ=255) tCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACATTAATTCGGTAGTGATGCCGATGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGACATATAAACAAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGGGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGaaa > 1:604841/1‑250 (MQ=255) aggctgcCGACTCTCGGCATTGGTGAGATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCTCTGCGCTATTTATGGGCATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATCTGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGAACGACGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGCTCTTCCAGGAAATGGAAGc > 2:58404/3‑251 (MQ=255) ctgcCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCtt > 2:230787/1‑251 (MQ=255) gACTCTCGGCAGGGGTGATATGAACAATCTCTTTAAAGGGCTGTTGAACCTTAATTGGGTAGTGATGCCGCTGCGTGATGTATGGGTATTTGTGGAATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCATAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACAGCCTGTGCCTGTTTGTCGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACtt < 2:321622/251‑2 (MQ=255) aCTCTCGGCATTGGTAATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGc < 1:156424/251‑1 (MQ=255) ctcGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGc > 2:206281/1‑248 (MQ=255) tGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTcc > 1:6228/1‑251 (MQ=255) gATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCTGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTTTTTGACGGGGATCTTCCCGAACATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTccc > 1:196557/1‑250 (MQ=255) atGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGtt > 2:386317/1‑251 (MQ=255) gAACACTCTCTATAACTGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACAGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCCGAGTGGACCTTCCAGTTgg > 2:237616/1‑251 (MQ=255) tGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGAGAAGAAATATAAACCAGAATATGACTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGACGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCacc > 1:512570/1‑249 (MQ=255) gTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCg < 2:464076/250‑1 (MQ=255) aCCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTtgtg > 1:127255/1‑251 (MQ=255) cGCTGCGTTATTTATGGGTATGTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTGCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGata < 2:450824/251‑1 (MQ=255) gCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTc < 2:143163/250‑1 (MQ=255) gTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGcgcg > 1:588873/1‑251 (MQ=255) ggCATTTATTGCTGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAAGATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCTGGATTTGGTGTTGTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTTTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCg < 2:588873/249‑1 (MQ=255) aTTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATa < 1:320840/251‑1 (MQ=255) tATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGt < 2:401222/250‑1 (MQ=255) tGGCGCATAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTGCCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCGAGTTGGCGCGGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCTGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTc < 1:568960/250‑1 (MQ=255) tGGCGCAGAAATAGAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGGTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTc < 2:298733/250‑1 (MQ=255) gggCGCAGAAAGATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCGTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGt < 2:198975/248‑1 (MQ=255) tataAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAAAGACAGTCGCGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTCCCTGTTCGACGGGACTCTTCCCGAAAATGGACGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGCTTGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGCAGGATTAGGACTGCTATTCCCGCTGCTGGCGAGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGAc > 1:312213/1‑251 (MQ=255) aaaCCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGTATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGActct < 1:386317/251‑1 (MQ=255) atatGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGATTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTCTTGTGGTCGGTGACGCTGCCTCGGGc > 2:121494/1‑246 (MQ=255) tCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGCTTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGACTAGTAAATAAGTATTGTGCTCGGTGACGCGGACTCTGGCAGATCTGAcc > 2:420408/1‑251 (MQ=255) aataaGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACAt > 2:139635/1‑251 (MQ=255) aataaGCCTATAGAAATGACCGTCGGGATATGGTGTTTTGACTTTACACACTCAGCTTGTTTGACGGGGATATTCCCGCAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGATGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTCGGATTCGGACTGATATTCACGTTGCTGGCGCGTAAAGCGAATGGTAAATAATTATTGTGGTCGGGGACGCCGACCATGGCAGCTCTGACCCGTTTTTACAt > 2:296280/1‑251 (MQ=255) aGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATc < 1:199875/251‑1 (MQ=255) ggCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGaa < 1:139635/249‑1 (MQ=255) cAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGGTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAAGAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATgc < 2:332423/251‑1 (MQ=255) cAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATgc > 1:591064/1‑251 (MQ=255) aaTGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAACGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATgcg > 2:208433/1‑251 (MQ=255) gACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGGAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATgcgcgc > 1:25355/1‑251 (MQ=255) ccGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGGTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATGCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACGCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCaa < 1:409937/251‑1 (MQ=255) gATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAg < 2:10437/251‑1 (MQ=255) aTTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAgg > 2:227412/1‑251 (MQ=255) ccTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAGGACATATACTGGCg > 2:318288/1‑251 (MQ=255) ccGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAGGACATATACTGGCGG‑TTTgg < 1:206281/251‑1 (MQ=255) cGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGCTCTTCCCGAACAGGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGCCTGATATTCACGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAGGAAATATACAGGCGGGTTTgg > 2:19349/1‑251 (MQ=255) gCCTGTTTGACGGGGGTCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAGGACATATACTGGCGG‑TTTGGATAATAGa < 2:127255/251‑1 (MQ=255) ggggATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATCGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAGGACATATACTGGCGG‑TTTGGATAAAAGATCTTGAAGccc > 1:592775/1‑250 (MQ=255) | GGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAACCAGAATATGTCTTTATTCGTAATAAGCCTCTGGCAATGACCGTCGGGATTTGGTGTTTTGCCTTTACCGCCTTTGCCTGTTTGACGGGGATCTTCCCGAAAATGGAAGCCTTCACTGCAGAGTGGACCTTCCAGTTGGCGCTGAATGTTGCAACGCCGTTTGTGCTGGTAGGATTAGGACTGATATTCCCGCTGCTGGCGCGTAAAGCGAATAGTAAATAATTATTGTGGTCGGTGACGCTGACTCTGGCAGATCTGACCCGTTTTTACATAATCGAGAAATGCGCGCAAGCCGCAGGACATATACTGGCGG‑TTTGGATAATAGATCTGGAAGCCT > NC_000913/948281‑948774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |