| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3958551 | 145 (2.040) | 3 (0.040) | 3/488 | 3.9 | 2.2% | coding (582/1476 nt) | ilvC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+)) |
| ? | NC_000913 | 4626635 = | 126 (1.780) | coding (724/1383 nt) | radA | DNA recombination protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ATCGAACAGATCTGCCTGATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGCGATGAAGTGACCTCCGGTAGCTCAGTGATGGTGGTATGGGAAGGAACGCGTCCACTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGA > NC_000913/4626386‑4626884 | aaCAGATCTGCCTGATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTg < 1:110527/251‑1 (MQ=255) aaCAGATCTGCCTGATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTg < 2:534732/251‑1 (MQ=255) gccggATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCTTATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGATTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGAt < 2:333026/247‑1 (MQ=255) gCCTGATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGAAACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGAt > 1:538959/1‑251 (MQ=255) gCCTGATGGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGGCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGc < 2:378949/248‑1 (MQ=255) cTGATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGGGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGc > 1:299218/1‑251 (MQ=255) gATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCg > 1:31223/1‑251 (MQ=255) gCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTGCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTc < 2:181894/251‑1 (MQ=255) cGAAGAAAAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTTTTTGACCCGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGGGGGGGACCTCACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCGGGCCCGCAAGTGGTGGACCCATGGCTCGCCTGTTCGGGGCCTTTGGATGGCGACGCCGACTccc > 2:263773/1‑251 (MQ=255) gaagaaGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTTGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGCAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACCCCCg > 1:332759/1‑251 (MQ=255) aagaGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGtttt < 1:146972/251‑1 (MQ=255) agagCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTc < 1:272388/251‑1 (MQ=255) agCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAATGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGCGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGc > 1:231568/1‑251 (MQ=255) aaCCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCCCGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGGGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTccccgatcgggagg > 1:500239/1‑240 (MQ=255) aaCCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCAcc < 1:88869/251‑1 (MQ=255) aaCCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGAGCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTccc < 2:500239/240‑1 (MQ=255) aCCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGGGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCt > 1:11950/1‑251 (MQ=255) aaGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGGGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCCTGGGGGGGGACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGGAAGTGCTGGGAAACTGGATCTACTGTTCTGTGCTTTTTGATGGCGATGCCGACTCCCCGTTTCTCACCtttcg > 2:325459/1‑248 (MQ=255) tggcTCGATCCAGGGGATGCATATGGCGGATGTACAGGCATCGCCTGGGAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAACCGCGCGGTGGGGCGATTGTCAGGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAAc < 2:461982/247‑1 (MQ=255) gACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCTTCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGCGAAACGGCGGCTTATTTAAAACGCTTCGCCAACACGCGCGGCGTGGCGTTTGTCATGGTGGGGGACGTAACCAAAG‑AGGGTTCGCGGGCTCGCCCTCAAGCACTGGAACACTGTATCGACTCGTCGGTGCTTTTGGGAGCCGATGCCGACCCCCGTTTTCGCACCTTACGCATCCATaaaacccc > 1:406878/1‑247 (MQ=255) gACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGGGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCg > 1:44247/1‑251 (MQ=255) ccGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAGTCATCGCCGGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCtt < 2:284863/250‑1 (MQ=255) 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atatGGCAGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATg > 1:328112/1‑249 (MQ=255) atGGCGGATGAACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGAGGAACGGCGGCTTCTTTGACACGCCTCGCCCAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCCAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGCAAGAGCTGGAACACTGTATCGACTGTTAGGGGCTTTTTGATGGAGATGCCGAACCCCGTTTTCGCCCCCTGCGCAGCCATAAAAACAGCTTCGGCGCGGTGAAAGAGCt > 2:273952/1‑251 (MQ=255) ggCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCCAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGGGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGATGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGCTGGCGCTGCCGACCCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGCATGAGCTgg > 2:252685/1‑251 (MQ=255) ggCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCGCCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTgg < 1:98503/251‑1 (MQ=255) ggCGGATGTACAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTg < 1:7364/250‑1 (MQ=255) ggCGGATGTACAGTCATCGCCTGGGAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGGGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTg < 1:604189/250‑1 (MQ=255) 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acggTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTc < 1:482461/247‑1 (MQ=255) cAGTCATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTGCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGTTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACCCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTcgc < 1:252556/251‑1 (MQ=255) cATCGCCTGGTAGCGTGGCGCAGGTGCGTGAAACGGCGGCTTATTTGACACGCTTCGCCAAAACGCGCGGTGTGGCGATTGTCATGGTGGGGCACGTAACCAAAG‑ATGGTTCGCTGGCTGGCCCGAAAGTGCTGGAACACTGTATCGACTGTTCGGTGCTTTTGGATGGCGATGCCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATg < 1:443808/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |