| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,492,843 | 0 | C | T | 28.9% | 60.2 / 10.6 | 45 | F92F (TTC→TTT) | tsgA | putative transporter TsgA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/27); new base T (13/0); total (18/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.17e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.89e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑TTTTCCCAATGATCGCCGCGT‑TTCTACTGGCGCGCAGCATTGAGTGGTACTGGGTTTATGCCTGCATCGGGCTGGTGTATGTCGCT > NC_000913/3492599‑3493092 | ggATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑GCGG‑TTTTTTGTTCAGCcac > 2:411827/1‑251 (MQ=255) ccTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑T‑CCGG‑TTTGTTGTTTAGCCCCAGCCTGGCGCT‑GTtc > 1:419671/1‑251 (MQ=255) tACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGCAATATCGCCGATTATTTCACTCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑GTTGGTGTTTAGCCCCACCCCGGCGCT‑GTtctt > 1:200586/1‑250 (MQ=255) aCGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATCGTGATGGGCAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑TCGG‑GTTTATGTTTAGCCCCAGCCTGgcggcgttcttc > 1:230145/1‑242 (MQ=255) actgactgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑GTTGTTGTTTAGCCCCAACCTGGCGCT‑GGTCTcggcgg > 1:136434/1‑251 (MQ=255) ccGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGc < 1:128407/251‑1 (MQ=255) aTGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTGCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTGGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCAt < 2:225120/251‑1 (MQ=255) ggTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑GTTGATGTTCAGGCACAACCTGGCGCT‑GGTCTCGGGGGGG‑GTG‑TTCCTTTTC‑GGGGGGGGCAGCGGccac > 1:416034/1‑247 (MQ=255) gTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCAc < 1:149251/251‑1 (MQ=255) tGATGGGACACATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGAATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGCTGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑GTTTATTTTTAGCCACACCCCGG‑GCTTCTTCTCGGGGGCG‑ATG‑TTATTTCTCCGGGGGGGTCggcggcgtccc > 2:182421/1‑246 (MQ=255) atatCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGGGTTTG‑TGTTTCGCCCCAGCCCGGGGGT‑GTTTTCGGGGGCGGCTG‑TGC‑TTCTC‑GGGGTGGGCAGCAGCATCAccctctagctt > 2:113135/1‑242 (MQ=255) gCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑GGCCGG‑TT‑GGTGGTCTGGCACAGCCCTGCGGG‑GTTTTCCGCGGCGGATG‑TTCTTTCTC‑GGGGGGGT‑AGCGGcctccacctcgcggattggtc > 1:4875/1‑231 (MQ=255) attattTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑c < 2:362360/251‑1 (MQ=255) tattTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑cc < 1:44551/250‑1 (MQ=255) ttCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GGTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTgg < 2:175497/250‑1 (MQ=255) cAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGGGTTTG‑TGTTTAGCCCCAGCCTCGCGCC‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTTTC‑GGGGTGGGGGGCGGCATCCACATGTCGATTGGTACCTT‑TCTggga > 1:350429/1‑248 (MQ=255) gCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAacac < 1:17094/248‑1 (MQ=255) ccAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTTAGCCAAAGCCAGGCGCT‑GGTTTCGGCGGGG‑GTGGTTC‑TTTTC‑GGGGGGGGTAGCGGCCTCACCAAGTCGGTTTGTACATT‑CCTGGGAAAACAAATGTAtta > 1:205826/1‑248 (MQ=255) gTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACTTT‑CCTGGTAACACAAAGGTATGAAggg < 1:366924/251‑1 (MQ=255) gAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑Tc < 1:411827/251‑1 (MQ=255) aaTACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGGTGTTTCGCCCCACCCCGGCGCT‑GTTTTCGGCGGCG‑GTG‑TTCCTTTTC‑GGGGGGGGCAGCGGGATCACCCTGTCGGTTTGTTCATT‑CCTGGTAACACAAATATATGAAGGGCG‑TCAgcg > 1:339247/1‑251 (MQ=255) aCGCCGGCATTTTAATCTCTAGCTGCCTCAACGCCTGGCTTAGGGAAAGCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCGGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TGCATTCTC‑GGGGTGGTCGGCGGCATCACCATGTCGATGGGTACATT‑CCTGGGAACGCAAATGTAGGAAGGGCG‑TCAGCGCGTTTCCCGCCTGTTAttt < 2:61318/251‑1 (MQ=255) 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ccTCAACGCCTGGCTGAGGGAAATCGTCCCGTGGAAAACGCATTGAGGTTTTGTCTTTCTCCTGATGGTGCTGGGGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCGC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTg < 2:137734/251‑1 (MQ=255) ccGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGgatg < 1:101089/250‑1 (MQ=255) gccggtcTGATGGAAACCGTCCCGTTGAAACGGTGGTTAGGTTTTGTTTTTTTCTTGATGGTGCTGGGGGTT‑G‑CCGT‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATGGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGgatga‑t < 2:264055/245‑1 (MQ=255) ccTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTAcc < 1:129040/221‑1 (MQ=255) ttgctgtgtgAAATCGTCCAGCTGAAAACGCAGTAGCGTTTATGCTTTCTCCTGTGGGTGCTGGCGGGT‑G‑CCGG‑TTTGAGGTGCAGCCACACCCTGGCGCG‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCTGTCTC‑GGGGTTGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCGGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑tt < 2:313816/240‑1 (MQ=255) ggCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑T‑GCGG‑TTTGATGTTCAGCCCCAGCCCGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTTTT‑GGGGGGGGCAGCGGCATCACCCTGTTGATTGGTACATT‑CCTGGGGACACAAAAGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGGTATTTTCCGACTCCTT‑CTTTAGTA‑TGGCTGGGGTGG‑ttttt > 1:372887/1‑250 (MQ=255) gATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGGGTTTG‑TGTTTAGCCACAGCCCGGCGCT‑GTTTTCGGCGGGG‑GTG‑GTCATTTTC‑GGGGGGGGCAGCGGCCTCACCCTGTTGATTTGTACCTT‑CCCGGGAACACAAAAGTATGAAAGGCGGTCA‑CGCGGTTTCCCCCCGTTTTTTTTCCACTCCTT‑CTTCCGTA‑tgggtggggttgtttttccc > 1:127414/1‑238 (MQ=255) aTGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCCG‑GTTGGTTTTTAGCCCCCACCTCGCGCT‑GTTTTCGGGGGGG‑GTG‑TTTATTTTC‑GGGGGGGGCAGCGGGATCCCCATGGCGAGTGGGAAATT‑TCTTGTAACACAAATGTATGAAGGGGG‑GCCGCGCGGGTCCCGCCTGGTATTTACCGACGCCTT‑CTTCAGTAATGG‑TGGGATGAGTTTTccac > 1:12426/1‑248 (MQ=255) ccGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGGGTTTG‑TGTTTAACCACCACCCGGGGCC‑GTTCTCCGGGGCG‑GTG‑TTCATTCTC‑GGGGCGGTCAGCGGCACCACCATGTCGGTTTGTACAAT‑TCTGGGCACCCAAATGAATGAAGGGGG‑TCAACGCGGTTCCCGCCTGTTTTTTACCGACTCCTTTCTT‑AGTT‑TGGGTGGGGTGG‑TTTTTCCAATggaccccgcggt > 1:299794/1‑240 (MQ=255) 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gtcTGGTGGTT‑G‑CCGG‑TTTGTTGTTCGGCCACGGCCTGGCGCT‑GTTCTGGGCTGCG‑ATT‑TTCGTTCTC‑GGGGTGGTCGGCGGCATCACCAGGGCGATTGGGTGTTT‑CCTGGTAAGACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGGTATTTACCTACGCTTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑GTTTCCCAAGGATCGCCGCGT‑GTCGACGTTCGCGCAGCAGTGAGTGGTAGTGTGTTTATGcc < 2:220726/249‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCGCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGGCAGCGGCATCACCATGGCGATTGGTACAGT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCGGCGCGGTTCCCGCCTGTGATTTACCGACTCCTT‑CTTCGGTA‑TGGCTGGGATGA‑GTTTCCCAATGACCGCCG‑GTATTCGACTGGCGCGCAGCATTGAGTGGGACTGGGTTTATGcc < 1:422089/250‑1 (MQ=255) gggTT‑G‑CGGG‑TTTGATGTTCAGCCACGGCCTGGCGCT‑TTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑TTTTCCCAATGATCGCCGCGT‑TTCTACTGGCGCGCAGCATTGAGTGGTACTGGGTTTATGCCTGCATc < 2:111803/250‑1 (MQ=255) cGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑GTCATTCCC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACGCAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTGCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑TTTTCCCAATGATCGCCGCGT‑TTCTACTGGCGCGCAGCATTGAGTGGTACTGGGTTTATGCCTGCATc < 1:447597/251‑1 (MQ=255) ggTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑TTTTCCCAATGATCGCCGCGT‑TTCTACTGGCGCGCAGCATTGAGTGGTACTGGGTTTATGCCTGCATCg < 2:136434/251‑1 (MQ=255) gg‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCT‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑TTTTCCCAATGATCGCCGCGT‑TTCTACTGGCGCGCAGCATTGAGTGGTACTGGGTTTATGCCTGCATCGGGCTGgt < 1:98587/251‑1 (MQ=255) 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GGATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTGAAAACGCAGTTACGTTTTGGCTTTCTCCTGATGGTGCTGGCGGTT‑G‑CCGG‑TTTGATGTTCAGCCACAGCCTGGCGCT‑GTTCTCGGCGGCG‑ATG‑TTCATTCTC‑GGGGTGGTCAGCGGCATCACCATGTCGATTGGTACATT‑CCTGGTAACACAAATGTATGAAGGGCG‑TCAGCGCGGTTCCCGCCTGTTATTTACCGACTCCTT‑CTTCAGTA‑TGGCTGGGATGA‑TTTTCCCAATGATCGCCGCGT‑TTCTACTGGCGCGCAGCATTGAGTGGTACTGGGTTTATGCCTGCATCGGGCTGGTGTATGTCGCT > NC_000913/3492599‑3493092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |