| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,326,450 | 0 | T | G | 30.8% | 112.1 / 14.4 | 65 | G114G (GGT→GGG) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/41); new base G (20/0); total (24/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.75e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTAC > NC_000913/2326207‑2326698 | aaTTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATggga > 1:295829/1‑248 (MQ=255) gccATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGGAAattacaggtt > 1:6289/1‑243 (MQ=255) aTTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAG‑TTTAgt > 1:31787/1‑250 (MQ=255) tGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTAt < 2:25110/231‑1 (MQ=255) gCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCtact < 1:559751/250‑1 (MQ=255) aaaaaTCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCtacttac < 1:626346/251‑1 (MQ=255) aaaTCGATTCACAACACGTTGATGAATTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTGAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCTGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCGGCCCAGGCCATTCAGGCAGGGCAGGCGCATAGGGTTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTc < 1:50948/251‑1 (MQ=255) aTTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAAAATTAG‑GTTAGccccccacctatttgatgc > 1:543124/1‑236 (MQ=255) acgctgtgatgaAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGGATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCGACTTACTCGATGCAAAAGCAc < 2:427587/245‑1 (MQ=255) acacGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAACAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGTGGGGATGGAAAATATTGG‑TTTTGcccccccctttcaccctgccaaagaac > 2:707795/1‑229 (MQ=255) cacGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACg < 1:549931/251‑1 (MQ=255) cGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACACGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGCTGGGAAAAATGGG‑TTTTTCCCCCCACTTTCTCGATGCAAAAACACGcc > 2:293892/1‑250 (MQ=255) gatgaAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTg < 1:4694/250‑1 (MQ=255) atgaAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCtacttac < 2:557816/228‑1 (MQ=255) atgaAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCaaa < 2:22650/238‑1 (MQ=255) atgaAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAG‑GTTAGCCCCCTACTTACTCGATGccaa > 1:22650/1‑235 (MQ=255) atgaAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAG‑GTTAGCCCCCtccttacagatcgggagagcacacggctgg > 1:557816/1‑228 (MQ=255) aGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATc < 1:92449/251‑1 (MQ=255) aTTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATc < 1:478821/247‑1 (MQ=255) tATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGAGGGGAAAAATGGG‑TTTAGCCCCCTCCTTTCTCGCTGCAAAAGCAAGCTCTGGTTATCGT‑TTTg > 2:623465/1‑251 (MQ=255) gggTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAG‑GTTAGGCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTgg > 1:500077/1‑249 (MQ=255) ggTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTAACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAG‑TTTATCCCCCCACTTAATCGATGCAAAAGCAAGCTCTGGGTTTCGT‑CCTGgagg > 1:142382/1‑250 (MQ=255) aCAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGTCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGTAAATATGTGCTTCAGCCCCCT‑CTTACTCGATTTGCAAGCACGCACTGGTTATTGG‑CTTGGGG‑ACggcacggctt > 1:156722/1‑243 (MQ=255) aCAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGttt < 1:589110/251‑1 (MQ=255) aaGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTAt < 1:473065/251‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGa < 1:308745/251‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGAc < 2:165183/251‑1 (MQ=255) gggCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCTCTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATGGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGAGGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGt < 2:269343/251‑1 (MQ=255) gggCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGGTGGCATATACGGTGTGCGGATTCACGGGCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGG‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGt < 2:128055/251‑1 (MQ=255) ggCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGG‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTg < 2:353709/251‑1 (MQ=255) gCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTgc < 1:122030/251‑1 (MQ=255) gCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAAGCCTgc < 1:550319/251‑1 (MQ=255) aaaaTCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGACACGGTGTGCGGCTTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGGAATATTAG‑TTTAGCCCCCTACTTAATCCCTGCACAACGACGCCCTGGGTATTCT‑CTTTGAG‑GCGGGCAGGGTTATGACGTAATCCttcgg > 2:630125/1‑247 (MQ=255) aaaaTCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAATATTAG‑TTTAGGCCCCTCCTTTCTCGATGCAAAAAAACGCCCTGGGTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGGCAGGGTTTTTACGGAATCCTgcgc > 2:274247/1‑251 (MQ=255) gTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGCAAAAATGAG‑GTTTGCCCCCTCCTTTCTCGATTGAAAAACCCGACCTGGTTATCCT‑CTTTGAGCAGGGAAAGGTT‑ATTACGTAAACCTTCGCGATG‑GCCTggtg > 1:317231/1‑248 (MQ=255) aaaaaaGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑At < 1:415862/250‑1 (MQ=255) aaaGAGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTAACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGt < 2:53876/251‑1 (MQ=255) ggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCTGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCat < 1:445941/251‑1 (MQ=255) ggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCat < 1:485881/251‑1 (MQ=255) gCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCCCGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCata < 2:551728/251‑1 (MQ=255) cTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGGCAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCCCCC‑AGGGTTCTCatat > 1:9838/1‑251 (MQ=255) aGAAACGGTGTGCGGATTCCCGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAGCACCCTCTGGTTATCGT‑CTTGGGG‑ACGGACAGGGTTTTGACGGAATCCTGCGCGATG‑GGCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGGTATAATATggggg > 1:161281/1‑250 (MQ=255) gtgtGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTAccgc < 2:543124/251‑1 (MQ=255) gATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGAGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAAAATTGG‑TATTGCCCCCCACTTACTCGCTGGGAAAGAACGCTCCGGGTATCGT‑CTTTGAG‑ACGGACAAGGTTATTACGGAAACCCGCCCGGAG‑GCCCGATGGGCGCCCCCC‑ATTGTTATCATTTTGGGGTTAACGCCGaaaa > 2:48154/1‑250 (MQ=255) cGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTTGCCCTTGCCGCGCAGGCCAGTCAGGCGGGTCCGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGAAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTGTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATCACCGCCGAAAACGTGGCt < 2:142382/251‑1 (MQ=255) aaTAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAaga < 1:623465/251‑1 (MQ=255) aTAAAGGATGGGGCTCGGGTCTTCAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGCGCATTGTGGAGGGGGGGAGGGCAAAAATTGG‑CTTATCCCACTACTTACTCGATGCACAAGCACGCCCCTGTTGTCGTACTTAG‑G‑CCGGACAGGTTTCTGACGTAATCCTCCGCGACT‑GCGCGCTGTGCGCCACCC‑CTCGTTATAATATTGGGGTTACCGCCGAAAACgggggccaag > 2:732590/1‑240 (MQ=255) aGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACg < 1:274247/251‑1 (MQ=255) tATGTGGTTCGGGTCTTCAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGAGGGAAAAAATGAA‑GTTAGTCCCCTACTTACCCGATGCAAAAGCACGCTCGGGTTATAGC‑CTTGGGG‑ACGGGCAGGGTTATGACGTGATCCTGGCCGATGTGCC‑GATTGGCGCCACCC‑ATGGGTATTATATGGGGGATGCCGCCGAAAACGGGGGTAAagaggaaggg > 1:550549/1‑245 (MQ=255) gtgGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGGAAAAATGGG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGGTGCAAAAGCAAGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑AAGGGCAGGGTTATGAAGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTTGTGTGGGCCACCC‑ATGGGTATCATATTGGGGTTACCGCCGAAAACGTGGCTAAagaggatgggaat > 1:287654/1‑242 (MQ=255) gaaaaGGGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCAAGTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTATCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑AGGGTTATCATAGGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATg < 2:275125/249‑1 (MQ=255) aaaaGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGAAAAAATGTG‑CTTAGCCCCCCACTTTCCCGATGCAAAAGCACGCCCTGGTTATCGT‑CTTTGAG‑ACCGGCAGGGTTATTACGGAATCCTGCGCGCTG‑GCCTGATGTGGGCCCCCCCATGGTT‑TCATATGTGGATTACCCCCCCAAACGTGGCTAAAAAGTACGGGAtttaccgttaaaaggc > 2:692782/1‑237 (MQ=255) gtgGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGTTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATGTGGGGATTACCGCCGAAACCGTGGCTAAAGAGTACGGAATGACCCGTGAAATGCAGGATGa < 1:147178/251‑1 (MQ=255) ggCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCTTATTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTGGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAAGCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTTGATAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGaa < 1:736380/250‑1 (MQ=255) ggcaggTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAG‑ATTAGGCCCCTACTTACCCGCTGCACAAGCACGCCCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGGGCCCCCC‑CTGGTTCTCATATGGGGGTTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGGACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTaaa > 1:694721/1‑250 (MQ=255) gcAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTAt < 1:147391/103‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAT‑TTTAGCCCCCTACTTACTCAATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAAt < 2:68822/251‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAAt < 1:293892/251‑1 (MQ=255) agCATTGTGGCGGGGGGTAGGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTTCTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGa < 2:287654/251‑1 (MQ=255) gCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAg < 1:11216/251‑1 (MQ=255) tgtgGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCTAACTTCCTTGATGCAAAATCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGGCAGGTTTATGACGGAATCCTGCGGGATG‑GCCTGATGGGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTGCATGCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTcc < 2:37373/250‑1 (MQ=255) gtgGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCA‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCg < 1:211157/250‑1 (MQ=255) tgGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGAAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGCG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGCTG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATTGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGGGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTAAATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCggg > 2:620831/1‑250 (MQ=255) ggCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCCCCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGt < 1:45005/250‑1 (MQ=255) ggTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CGTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTACTCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACAC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTAc < 2:550549/251‑1 (MQ=255) | AATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAG‑TTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGT‑CTTGGAG‑ACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATG‑GCCTGATGTGCGCCACCC‑ATGGTTATCATATGGGGATTACCGCCGAAAACGTGGCTAAAGAGTACGGAATTACCCGTGAAATGCAGGATGAACTGGCGCTACATTCACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTAC > NC_000913/2326207‑2326698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |