| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (19/31); new base G (20/5); total (43/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACGTTACAACCCATCGCTCGTGTCGATGGCACTATTAATCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGTGCCCTGGAGTTGTTCCTCGGT‑AACGCCGGAACGGCAATG‑CGTC‑CGC‑TGGCGG‑CAGCTCTTTGTCTGGGTAGCAATGATATTGTGCTGACCGGTGAGCCGCGTATGAAAGAACGCCCGA‑TTGG‑TCATCT‑GGTGGATGCGCTGCGCC‑TGGGCGGGGCGAAGATCACTTACCTGGAACA‑AGAAAATTATCCGCCGTTGCGTTTACAGGGCGGCTTTACTGGCGGCAACGTTGACGTTGATGGCTCCGTTTC > NC_000913/958824‑959317 | ccGTTACAACCCATCGCTCGTGTCGATGGCACTATTAATCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGTGCCCt < 2:525518/250‑1 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ACGTTACAACCCATCGCTCGTGTCGATGGCACTATTAATCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGTGCCCTGGAGTTGTTCCTCGGT‑AACGCCGGAACGGCAATG‑CGTC‑CGC‑TGGCGG‑CAGCTCTTTGTCTGGGTAGCAATGATATTGTGCTGACCGGTGAGCCGCGTATGAAAGAACGCCCGA‑TTGG‑TCATCT‑GGTGGATGCGCTGCGCC‑TGGGCGGGGCGAAGATCACTTACCTGGAACA‑AGAAAATTATCCGCCGTTGCGTTTACAGGGCGGCTTTACTGGCGGCAACGTTGACGTTGATGGCTCCGTTTC > NC_000913/958824‑959317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |