| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,279,050 | Δ82,373 bp | [ghxP]–[cadC] | 72 genes [ghxP], yjcE, yjcF, actP, yjcH, acs, ytcB, nrfA, nrfB, nrfC, nrfD, nrfE, nrfF, nrfG, gltP, yjcO, fdhF, mdtP, mdtO, mdtN, ytcA, yjcS, alsK, alsE, alsC, alsA, alsB, alsR, rpiB, yjdP, phnP, phnO, phnN, phnM, phnL, phnK, phnJ, phnI, phnH, phnG, phnF, phnD, phnC, yjdN, yjdM, rdcA, rdcB, proP, pmrR, basS, basR, eptA, adiC, adiY, adiA, melR, melA, melB, yjdF, fumB, dcuB, dcuR, dcuS, yjdI, yjdJ, ghoS, ghoT, lysU, dtpC, cadA, cadB, [cadC] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4279050 | 4361422 | 82373 | 47 [1] | [0] 46 | [ghxP]–[cadC] | [ghxP],yjcE,yjcF,actP,yjcH,acs,ytcB,nrfA,nrfB,nrfC,nrfD,nrfE,nrfF,nrfG,gltP,yjcO,fdhF,mdtP,mdtO,mdtN,ytcA,yjcS,alsK,alsE,alsC,alsA,alsB,alsR,rpiB,yjdP,phnP,phnO,phnN,phnM,phnL,phnK,phnJ,phnI,phnH,phnG,phnF,phnD,phnC,yjdN,yjdM,rdcA,rdcB,proP,pmrR,basS,basR,eptA,adiC,adiY,adiA,melR,melA,melB,yjdF,fumB,dcuB,dcuR,dcuS,yjdI,yjdJ,ghoS,ghoT,lysU,dtpC,cadA,cadB,[cadC] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4279049 | 1 (0.010) | 46 (0.680) | 42/488 | 0.3 | 98.9% | coding (571/1350 nt) | ghxP | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
| ? | NC_000913 | 4361423 = | 0 (0.000) | coding (512/1539 nt) | cadC | DNA‑binding transcriptional activator CadC | |||||
CGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTTCCCGGTGATTATGTCACTGGTAGGTCTGGCGGTGATCATCGGCCTGGAAAAACTGAAAGTCCCTGGTGGCATTCTGCTGACCATTATCGGTATCTCAATTGTCGGTTTGATCTTCGATCCTAACGTCCATTTCTCCGGCGTTTTCGCCATGCCTTCATTGAGCGATGAAAACGGCAATTCACTGATTGGCAGCCTGGACATTATGGGCGCGCTGAATCCTGTAGTCCTGCCAAGCGTTCTGGCGCTGGTGATGACGGCAGTATTTGATGCCAC > NC_000913/4278805‑4279296 | cgcgCTGGGTGCCGTGTTCCTTATGGGTGGGCTGTTTACGGTAATTTCGGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGTTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCTGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGGGTCGGTCTGGTGATTAAAGACCCGCTGGATGGTCTGCCCGTTGCGCGGGGTGATAGCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCataccta < 1:578340‑M1/250‑8 (MQ=255) gggTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgac < 1:516271‑M1/249‑13 (MQ=255) gCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGGCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGATCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGGCataccgaacgacaacagg < 2:350809‑M1/251‑19 (MQ=255) cGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCTGTAGCTGGGTTTTGCGCAACTTGCCTCACGGGGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGCCCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgccaccaggt > 2:519991‑M1/1‑231 (MQ=255) gtgtTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaa < 1:227978‑M1/251‑22 (MQ=255) gggTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatac < 2:14146‑M1/251‑33 (MQ=255) ggTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGATT‑T‑TCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacc < 1:520839‑M1/251‑34 (MQ=255) gtgtGCTGTTTCCGGTACTTTATGCCACGGGTATCCGCAGCAGGATTTTGCGCAACTTGACTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCATGCTGCTCATTGCCGATAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgcccacaggaaaaaaaaccataccc > 2:355974‑M1/1‑217 (MQ=255) gtgCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccataccca > 1:343786‑M1/1‑215 (MQ=255) gCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaa < 1:149462‑M1/235‑23 (MQ=255) gCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaa > 2:149462‑M1/1‑213 (MQ=255) gTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTTATTAAAAACCCGCTTGATGGGCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACGGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaag < 1:383041‑M1/249‑40 (MQ=255) ggTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtga > 1:345815‑M1/1‑204 (MQ=255) gCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGTCCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgc < 1:566690‑M1/249‑56 (MQ=255) gCCACGGGTATCCGTAGCTGGATGTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaactacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttg < 1:352064‑M1/248‑55 (MQ=255) ggatcCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGGCGGTCTGGTGAGTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTGCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTTGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactg < 2:27557‑M1/249‑65 (MQ=255) tGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaacaaaccatacccaaaaggtggggaatcgtttgcttttaactggggattgttc > 2:177060‑M1/1‑176 (MQ=255) ggATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttc < 1:173907‑M1/249‑75 (MQ=255) gcgcAACTTGCCTCACGGTGGGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGTTGATTAAACACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGAGTTCGCGACCGCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatgcctaactacaacaggaaaaaaaaccattcccaaaatgttgttaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcg < 1:341298‑M1/250‑83 (MQ=255) ttGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtg > 1:286570‑M1/1‑161 (MQ=255) cACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcagctggcgttgcggtgtttt < 1:519991‑M1/249‑95 (MQ=255) aCGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatccctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttga > 1:261566‑M1/1‑154 (MQ=255) ggTGTGGCGCACGGCCCGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggaatgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatg > 2:149434‑M1/1‑152 (MQ=255) ggTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatg > 1:136175‑M1/1‑152 (MQ=255) gtgtGGCGCACGGCACGGGGAATGGTATCGGTCTGTTCATGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgt > 2:399641‑M1/1‑151 (MQ=255) ggcacggcacggGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagac < 2:97804‑M1/250‑107 (MQ=255) ggcacggGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGATCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggcagtgaatcgtttgtttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgtatgttaagactgtgg > 2:15968‑M1/1‑140 (MQ=255) tGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaat < 2:269716‑M1/250‑122 (MQ=255) ctgctgCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggcaccgcc > 2:556055‑M1/1‑113 (MQ=255) tgctgcTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggatccgcct > 2:55583‑M1/1‑112 (MQ=255) gctgctCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctc > 1:237412‑M1/1‑111 (MQ=255) aTTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTATGCCCGTTGCGCTGGCTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGACACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaacaaccatacccaaaaggtagtgcatagtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggttt > 1:577685‑M1/1‑104 (MQ=255) ttGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtat > 1:379528‑M1/1‑103 (MQ=255) gCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAATCCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccat < 2:31258‑M1/128‑31 (MQ=255) gCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggacaaaaaaccat > 1:31258‑M1/1‑98 (MQ=255) ggTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtg > 1:476820‑M1/1‑92 (MQ=255) ggTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCGGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtg < 2:476820‑M1/218‑127 (MQ=255) gTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctgggataggggggggcggagatagc > 2:337649‑M1/1‑85 (MQ=255) cTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTCGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcctt > 2:244105‑M1/1‑83 (MQ=255) tAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccggcactggtatcgggggaggcgaagatagcattatttcctc > 2:357573‑M1/1‑75 (MQ=255) tGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTAGTAGGTCctacctaacgacaacaggaaaaaaacccatacccacaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataac > 1:38759‑M1/1‑48 (MQ=255) gACCTCCCCGGTGAT‑‑TGTCACTGGCAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggcagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccggcaccattaatttat > 1:221205‑M1/1‑30 (MQ=255) ctccccggtGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaaccggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgattttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgactctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccggcaccattaatttatagcc > 1:543793‑M1/4‑27 (MQ=255) ctccccggtGAT‑‑TGTCACTGGTAGGTCatacctaacgacaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgaatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccggcaccattaatttatagcc > 1:589801‑M1/4‑27 (MQ=255) tgattgtcaCTGGTAGGTCatacctaacgaaaacaggaaaaaaaaccatacccaaaaggtagtgaatcgtttgcttttaactggggattgttcaggtggcgttgcggtgttttgtatgttaagactgtgggagggagaatctgtggcagggaccgcctctggtatagggggaggcgcagatagcattatttcctcttcctcttcttcgctgtaccagataaccggccccattaatttctagccgcgctttg > 2:276621‑M1/5‑19 (MQ=255) tGTCCCTGGTAGGTCatacctaacgacaacagaaaaaaaaacaatacccaaaaggtattgattcgtttgttttaaactggggattgttcaggtggcgtggcggtgttttgattttaaagatggtgggagggagaatcgggggaaggaaccgcctctggtatagggggaggcgaagatagcattatttcctctccctcttcttcgctgtaccagataaccggcaccattaatttatagccgcgctttggta < 1:215021‑M1/250‑236 (MQ=255) ggTCTGGCGGTGATCATCGGCCTGGAAAAACTGAAAGTCCCTGGTGGCATTCTGCTGACCATTATCGGTATCTCAATTGTCGGTTTGATCTTCGATCCTAACGTCCATTTCTCCGGCGTTTTCGCCATGCCTTCATTGAGCGATGAAAACGGCAATTCACCGATTGGCAGCCTGGACATTATGGGCGCGCTGAATCCTGTAGTCCTGCCAAGCGTTTTGGCGCTGGTGATGACGGCAGTATTTGATGCCAc > 1:349747/1‑251 (MQ=255) | CGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTATCGGTCTGTTCCTGCTGCTCATTGCCGCTAACGGTGTCGGTCTGGTGATTAAAAACCCGCTTGATGGTCTGCCCGTTGCGCTGGGTGATTTCGCGACCTTCCCGGTGATTATGTCACTGGTAGGTCTGGCGGTGATCATCGGCCTGGAAAAACTGAAAGTCCCTGGTGGCATTCTGCTGACCATTATCGGTATCTCAATTGTCGGTTTGATCTTCGATCCTAACGTCCATTTCTCCGGCGTTTTCGCCATGCCTTCATTGAGCGATGAAAACGGCAATTCACTGATTGGCAGCCTGGACATTATGGGCGCGCTGAATCCTGTAGTCCTGCCAAGCGTTCTGGCGCTGGTGATGACGGCAGTATTTGATGCCAC > NC_000913/4278805‑4279296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |