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tGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCt > 2:202543/1‑211 (MQ=255) gtaaagccgacctccccacTGCGGCCGCTTTCGTTGCAACCCGTCT‑GGCTGCTGGACTCGGTTCTCTAGAGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGCTGGCGATTGGTTGCGACATCTCCCTGACAGCGTTTCCCGCATTCAGCCTGGTGCTGGAGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTAGGAGCCGTGTTCCTGCTGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTg > 2:291210/19‑251 (MQ=255) gtaaacctggtctCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCACCCTGTCT‑GTTTGCTGTACTCGGTTCTATCTTGATGGGGCTGTGGTCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTTCGGCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTTCTGGGTCAACATATTAGTGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTTATGGGTGTGTTGTTTACGGTAATTTCTGCCTCGGGTATCCGTAGCTGCATTTTg < 2:495982/239‑1 (MQ=255) aaGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTgcgc > 1:167076/1‑251 (MQ=255) aGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACt > 1:192843/1‑251 (MQ=255) aGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACt > 1:264948/1‑251 (MQ=255) gCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACg < 2:192843/251‑1 (MQ=255) cTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCCCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGCAGCTGGATTTTGCGCACCTTGCCTCACggg > 2:561190/1‑250 (MQ=255) gCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGgtgt < 2:484986/251‑1 (MQ=255) gCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACCTGCCTCACGgtgt > 1:11042/1‑251 (MQ=255) gCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGgc < 1:422022/251‑1 (MQ=255) | CGCTGGCAGGGGATTGTCCGCCACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAA‑T‑TTCACAACG‑TGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCT‑GGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGC > NC_000913/4278415‑4278903 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |