New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2538687 | 37 (0.580) | 3 (0.050) | 3/486 | 3.7 | 4.3% | coding (897/912 nt) | cysM | cysteine synthase B |
? | NC_000913 | 4128340 = | 95 (1.500) | coding (56/318 nt) | metJ | DNA‑binding transcriptional repressor MetJ | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGTCTCCGGGTTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTGACCGTAAACCCGCATAGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGCATATAATTTTAACGGCTATTTGGGATTTGCTCAATCTATACGCAAAGAAGTTTAGATG > NC_000913/4128090‑4128589 | cGTCTCCGGGGTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCCTTTGCCGCTTCCGGGAGGTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCTGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACATCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCAGCTGTGTGGATGTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCAc < 2:466264/251‑1 (MQ=255) gTCTCCGGGTTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGATTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCAct > 1:87734/1‑251 (MQ=255) ctcCGGGTTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCActct > 1:482056/1‑251 (MQ=255) gggTTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGCCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACAGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTcttctt > 1:382222/1‑251 (MQ=255) ggTTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTg < 1:247484/251‑1 (MQ=255) ggTTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGGAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTg < 2:283092/251‑1 (MQ=255) gTTAATCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGc < 2:307626/251‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTAGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTACGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGt > 1:481418/1‑251 (MQ=255) aTCCCCATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTg > 2:571276/1‑251 (MQ=255) cATCTCACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTc > 1:278175/1‑249 (MQ=255) cACGCATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGGCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTGTTAACTCCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGc < 2:172087/247‑1 (MQ=255) cATGATCTCTTTTGCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGc > 2:456559/1‑251 (MQ=255) taTCTCCTTGGCCGCTTGCGGGATTTCGGCGCTGCTCTCTTTTCGCATCTCGCCATCACCCGGCAAAGTTTGCCCGGTAAATGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGCCGCAGGTTGTTCACCTGACGACTCGTGCGTTCTTCGGTGAGGATTTTTAACTCCTTAAGAGGCATGGAAACCGTACGCTTTTTGACTTCTTCACTCTTCATGCCGTGATCAGCGTATGGGcg < 2:243930/248‑2 (MQ=255) 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2:300455/1‑212 (MQ=255) gCCGCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCAct < 1:300455/212‑1 (MQ=255) gCTTCCGTGAGTGCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCCGATATAGTCGCCGCt < 2:62435/251‑1 (MQ=255) gCTTCCGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACCCAGATCGGCATCATCCGGCAAGGGTTGCCGGGCAACGGCATGCAGAAACGCTTCGCACACCGGCCCGCGGTTGGTACCGGGACGCAGGTTGTTCACCTGACAACCGGTGCGTCCATCGGGGGGGATTTTTACCCCCTTAAGGGGAATGGAACCCGTAATCTTTTTGACTGTTTCCCCCTTCTTGCCTTGTTCAGCGATTGGGCTGATATATTccccgcc > 1:565264/1‑250 (MQ=255) ccGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCCTCCGGCAAAGCTTGCCCGGCAAAGGCATGCAGCAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTCCCGTGCTCCGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAt > 1:561052/1‑251 (MQ=255) ccGGGATTTCGTCGCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAt < 1:118747/251‑1 (MQ=255) gggATTTCGTCGATGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCCAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTc > 2:538780/1‑251 (MQ=255) cgtcgCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCCCAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACAACTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATg > 2:400771/1‑251 (MQ=255) gtcgCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt < 1:28879/242‑1 (MQ=255) gtcgCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 2:28879/1‑242 (MQ=255) gCTGCGCTCTTTACGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGACACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATg > 1:459929/1‑247 (MQ=255) gcTCTTTACGCAGAGCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTa < 2:200824/251‑1 (MQ=255) aCGCAGATCGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAAGCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCctct < 2:87734/251‑1 (MQ=255) 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cGGCATCATCCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTGCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCGCCTGACGACGCGTGCGGTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCGTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTGTTGACTTGGTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATACGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAAt < 1:564579/251‑1 (MQ=255) catcCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAGCGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTGTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAATCGTAATCTGTGTGACTTGGTCACTCTGCTTACCGTTCTCAGCGTATGGGCTGATATGTTGGCCGCTGTATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAAtt < 1:40105/250‑1 (MQ=255) atcCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg > 2:181047/1‑250 (MQ=255) atcCGGCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg > 1:57953/1‑250 (MQ=255) ggCAAAGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGAACAGCAGATCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCCCCTGACGACGAGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagacc > 2:498371/1‑251 (MQ=255) aGGTTGCCCGGTAAAGGCATGCAGAAACGCTTCGCACAGCAGCTCGCTGTTGGTAGCGTGACGCAGGTTGTTCACCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 2:459929/251‑1 (MQ=255) 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cGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTGACCGTAAACCCGCATAGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGc > 1:415937/1‑251 (MQ=255) cGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCGCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTGACCGTAAACCCGCATAGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGCGTGATAATGc < 1:36945/251‑1 (MQ=255) gTGAGGCTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTCATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCAGTGCTCAGCGTATGGGTTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTGACCGTAAACCCGCATAGTTTACCGTACAGGCGTTACCGTGACATCGTGTAATGCACCTGTCGGAGTGATAATgact > 2:204344/1‑248 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |