New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2841224 | 66 (0.890) | 3 (0.040) | 3/488 | 4.1 | 3.0% | coding (235/1425 nt) | ascB | 6‑phospho‑beta‑glucosidase AscB |
? | NC_000913 | 3907571 = | 126 (1.690) | coding (8/726 nt) | phoU | negative regulator of the pho regulon | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CAGGTCGCTCGCCGTCGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTGAACAGATCGTCCGTGTTGCTGAACTCAATCAATTCGCCCAGGTACATAAACGCCGTGTGGTCGGAACAACGCGCAGCCTGCTGCATGTTGTGGGTGACGATCACCACGGTGTAATCCTGCTTCAGTTCGGTGATCAGCTCTTCAATACGCCCGGTAGAGATAGGGTCGAGCGCC > NC_000913/3907321‑3907821 | cAGGTCGCTCGCCGTCGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGAc < 1:480237/251‑1 (MQ=255) cgctcgcCGTTGTCTGACGTTTGGCGATAAGGCGCGCGCAGGCTTCAGCTATCGCCTCTTCCCTCATGTTGACTTTCTTGTCGCCGTCGATGGCGCGCTTCGGCAGATCGCGGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCAGGCCGCCCATGGGCAGCACCTGCTTGCGGATACTTCCCAGATCTGCGGTGATCTGTCCGGAAATATGCTTATTCAGAGTGAGACAGTc < 2:668887/250‑1 (MQ=255) cgctcgcCGTCGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATGGAGACTGTc < 1:191220/250‑1 (MQ=255) cgctcgcCGTCGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTCGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTcc < 1:672293/251‑1 (MQ=255) gctcgcCGTCGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTcc > 1:416216/1‑250 (MQ=255) cgcCGTCGGCGGACGGTTGGCGATGATGCGCACGCTGTCTTCAGCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCTTCAGAGAGCTGCTGCTCGACCATGCCGCCCATGGTCATCTCTTGCGTGCGGATACTGTCCAGTGGGGGGTTGAACTGGCCGGAAATAGGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCAt < 2:651243/249‑1 (MQ=255) cGTCGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGc > 2:470689/1‑251 (MQ=255) cGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCAc < 1:125659/250‑1 (MQ=255) cGGCTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATGGAGACTGTCCATAACGCACt < 1:251952/251‑1 (MQ=255) cTGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAACTATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCt > 2:37744/1‑251 (MQ=255) tGACGTTTGGCGATAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTg > 2:575367/1‑251 (MQ=255) ggttGGCGATAATGCGCACGCAGGTGTCACCGATCGCCTCTTCCATCAGTTTGCCTGTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCATAAAGCTGCTTCGCCGCCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGGTCGGCGTGGAACTGTCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGATACTGTCCATAACGCACTCCTGAATc < 2:613865/249‑1 (MQ=255) gTTTGGCGCTAATGCGCACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGCCGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATCTGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCCCTCCTGAATc > 2:430165/1‑251 (MQ=255) ggCGATAATGCGCACGCAGGCTTAATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCCTCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGTACTGGCCGGCAATATGTTTATTAAGTTTGAGGCTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAAcc > 1:516388/1‑251 (MQ=255) gataaaacgcacccaGGCCTCATCGATCGCCATTTCCATCCAGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGACCGCTGTCTTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAACGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCACGGTCATAACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATCCGTTTATTAAGATTGCGACTGTCCATAACGCCCTCCTGAATCAACCGt > 2:624926/8‑250 (MQ=255) gcgcACGCAGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGGCGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCTCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGTTCATCACGTTCGTGCGGATACTTGCCGGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTAGTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGAcc < 1:305684/251‑1 (MQ=255) acgcgGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTg < 2:650201/251‑1 (MQ=255) acgcaGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGACTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTg > 1:621439/1‑251 (MQ=255) cgcaGGCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGACCTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTgg > 2:171327/1‑250 (MQ=255) catgCTTCATCGATCGCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCTGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATGGAGACTGGCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATg < 1:35571/248‑1 (MQ=255) tcagcgatcgCCGCTTCCCTCATGTTGACTGTCTTGTCGCCTTCGCTGACGCTCTTCGCCAGATCGCTGGCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCGGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCACCCGTAACGACCGGTGATGTAGt < 2:367740/245‑1 (MQ=255) atcgatcgCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGtcttc > 2:131504/1‑251 (MQ=255) atcgatcgCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGACTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTCTGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGACATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATCACGCACTCCTGCATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGtcttc > 1:328691/1‑251 (MQ=255) cgatcgCCACTTCCATCATGTTGACGTTCGTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCtg < 2:551864/251‑1 (MQ=255) gCCACTTCCATCATGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCtgttttt > 2:17936/1‑249 (MQ=255) 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atGTTGACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGc < 1:4914/251‑1 (MQ=255) gACGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGt < 1:519171/251‑1 (MQ=255) cGTTCTTGTCGCCTTCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCACCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTg > 2:562165/1‑250 (MQ=255) 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ttCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTGAACAGATCGTCCgt > 1:549807/1‑251 (MQ=255) tCGATGACGCGCTTCGCCAGATCGCTGCCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGACTCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTGAACAGATCGTCCgtg > 2:346020/1‑251 (MQ=255) cGATGCCGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCTCTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTGAACAGATCGTCCgtgt < 2:149243/251‑1 (MQ=255) 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aCGCGCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTGAACAGATCGTCCGTGTTGCTg > 2:360235/1‑251 (MQ=255) cgcgCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTGAACAGATCGTCCGTGTTGCTg > 1:158746/1‑250 (MQ=255) cgcgCTTCGCCAGATCGCTGTCCTGGTTATGCATCGCGGTGATTGCATCAGAAAGCTGCTGCTCCACCATGCCGCCCATGGTCATCACCTGCGTGCGGATACTTTCCAGTTCGGCGTTGAACTGGCCGGAAATATGTTTATTAAGATTGAGACTGTCCATAACGCACTCCTGAATCAACCGTAACGACCGGTGATGTAGTCTTCTGTTTGTTTCTTCGCTGGCTTGGTGAACAGATCGTCCGTGTTGCTGa < 1:330747/251‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |