New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2255147 | 40 (0.540) | 3 (0.040) +G |
3/486 | 4.1 | 3.3% | coding (40/942 nt) | rihB | pyrimidine‑specific ribonucleoside hydrolase RihB |
? | NC_000913 | = 3724072 | 137 (1.840) | coding (326/2070 nt) | glyS | glycine‑‑tRNA ligase subunit beta | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AAAGCGGTGGCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAACCTTCTGCCGCTTTGCTCGGTTTGCCTTCAGCGTCGAACGCCTGGGCAATCGCCGGGCCGCGTTTTTCGATTTCACGATCCGGTTGCGCTTCCGCCAGGTTAGCTACTTTCAGCGCCAGACGACGCGGAGCAGCAAACCATTGAACGGTGCCGTGTGCGAGGCCAGCGTTATCCAGCTCCGCAGTAAAGTTCGCAGCAAA > NC_000913/3723825‑3724319 | aaaGCGGTGGCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTc < 1:206585/250‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAggc > 2:127814/1‑247 (MQ=255) aaGCGGTGGCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTc > 1:328364/1‑249 (MQ=255) gCGGTTGCGGCGATTCACGCGATCGGACAGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACGTTGGCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGGCGCTTGCGCCCGAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCAGATTCGTCAGCATTGCTTCGGTTCTTTCGCCCTTCGCATTGGCGCGATACAGCAGCCATTCGTCTTTATCGTTAGTCAGAc < 2:645115/251‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGAc < 2:580036/251‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGAc < 2:556307/251‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCGCGAATCACGCGAGCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGAc < 2:236537/251‑1 (MQ=255) ggTGGCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTAGCCCAGCAGAAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGc > 1:428198/1‑251 (MQ=255) gggCCGCGAATCACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTGTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGcgc < 2:176981/250‑3 (MQ=255) cACGCGATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCa < 1:197506/250‑1 (MQ=255) gcccaagatggtGAATGCCCAGAATGGGTGCCGGAATGGCTTTGGCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCTCCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGGCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGGCAGAGATGTCTCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATGCAGGAGCCTTTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAAc < 1:74983/239‑1 (MQ=255) cgATCGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGGCTCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCTCCATCGCATCAGTTGCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGTGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCGTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGTTCAACGGt < 2:237584/251‑1 (MQ=255) cGGACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAAt > 1:153107/1‑250 (MQ=255) ggACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATAc < 1:266147/251‑1 (MQ=255) gACTGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGGCGCCCAGCATCAGGGTCACGGTGTGCACCGGAAGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCACCAACGCATCAGTTTCGGGATCGACAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCCGCAGTGCTTCGGTGGATTCGCCCTTCCCATGGGGGCGGTACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGGAGTCAGCCGCACAGCCTGGGCAACGGTAATaac > 2:31365/1‑249 (MQ=255) tGAATGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGc > 1:332180/1‑250 (MQ=255) aaTGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAAc > 2:369109/1‑251 (MQ=255) aTGCCCAGAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAAcc < 1:95192/251‑1 (MQ=255) acagcaTGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTGGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCCGCCATTCGCCTTTATCGGGATCCAGGCTCTCACCCTGGGCACCGGTAATACCGCAACCCcgc > 2:361330/6‑251 (MQ=255) gAATGGTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGCTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGcc < 1:164219/251‑1 (MQ=255) aaTGGATGCCGGACTGCCTTTGTCGCCCACCAGCAGGGTCCCGGTGTGCCCCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCACCGCATCCGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCCGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCAAATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTTGTCAGACGCTCCGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCAcgcgacc > 2:42796/1‑248 (MQ=255) ggTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCCGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGAGCCCAAc > 2:218723/1‑251 (MQ=255) ggTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCaa < 2:656426/250‑1 (MQ=255) gTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGCGAAGTCGCCACCATATTCGGCAGCCGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCCCGCGCCCAAcc > 2:447426/1‑251 (MQ=255) gTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAAcc < 1:127814/251‑1 (MQ=255) gTTGCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCAAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAAcc < 1:323945/251‑1 (MQ=255) gCCGGAATGACTTTGTCGCCCAGCAGCAGGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAACCtt < 2:255466/250‑1 (MQ=255) ccccAGCAGCAGGGTCACGGTGGGCCCCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCGCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAACCTTCCGCCTCTTTGCTCGGtt < 2:317935/250‑1 (MQ=255) 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agcagcagGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAACCTTCTGCCGCTTTGCTCGGTTTGcc < 1:636204/251‑1 (MQ=255) agcagGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCACCGCATCAGTTTCGGGCTCGGCAGTTTCGCCAGAGACGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTCTCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAACCTTCTGCCGCTTTGCTCGGTTTGCCTTc > 1:55541/1‑251 (MQ=255) agcagGGTCACGGTGTGCACCGGACGCACGAAGTGCACGTCGCTTGCGCCCCAACGCATCAGTTTCGGGATCGGCAGTTTCGCCAGAGAAGTCGCAACCATATTCGGCAGCAGTGCTTCGGTGCTTTCGCCCTTCACATGGGCGCGATACAGCAGCCATTCGCCTTTATCGGTAGTCAGACGCTCAGCCTGGTCAACGGTAATACCGCAACCACGCGCCCAACCTTCTGCCGCTTTGCTCGGTTTGCCTTc < 1:245848/251‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |