Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,278,682 | C→T | A68A (GCC→GCT) | ghxP → | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,278,682 | 0 | C | T | 98.4% | 223.2 / NA | 63 | A68A (GCC→GCT) | ghxP | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (31/30); total (33/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
CACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTAT > NC_000913/4278436‑4278924 | cACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTAGGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGAc < 2:507188/251‑1 (MQ=255) aCGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATc < 1:91114/251‑1 (MQ=255) aaaCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTGGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGTTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGt < 2:96593/251‑1 (MQ=255) aaCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACCCCTGGTTTAAAATTTTCCAACGTGGAAGCA‑CTGTTCCG‑CCGGAAGAGGTTTCCGGGTTTACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAAGGATTTTGGGTAAAAGAGGCTTCCCGCCCGCCGCAGCTTTCGTTGGCACCCGTCTGGTTGGTGGGCTCGGTTCTATCggggtggggt > 2:328131/1‑242 (MQ=255) aaCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGCTCACTCGTCGCCTGGTTTTAAATTTTACCACCTGGAAGCA‑CTTT‑CCGTCAGGGAGTGGGTGCCCGGGTAACAACGGTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTTCCGGGATGTTGGGTAAAGCAGGGTTCCCGCCCTCGGCAGCTTTCTTTGCAACCTGTCTTGTTGCGTGACTCGGTTCTATAGTGGTggggg > 2:394957/1‑249 (MQ=255) aCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCCACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGGAGGA‑CTGT‑CCCTCAGGAAAAGGGTGCCGGGATAACAACGGTTTTGGGGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGCTCCAGGGATGTTGGGTAAAACAGGCGTCCCGCCTGCGGCGGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTGGCTGGACTCGGTTCTATCGTGAGGGGTCt > 1:165138/1‑251 (MQ=255) aCTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCAGCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGGGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTAGCGTGATGGGTCt < 1:384535/251‑1 (MQ=255) ttcAGTGGATTTTTTTTTATTTCTACGCCATCAGCTGTTACGGGCGTTTCTCTCGACGCCGGTTTTAAAATTTCACACCGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGCCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTCCTCGGTCATCGTCGTTCTAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGTTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGTTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCtgt < 2:399333/249‑1 (MQ=255) ctcAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGGTTTAAATTTCACAAAGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGGAGAGGTTGCCGGGGTAACAACGTTTCTTGCGATGGTCTACTCGGGCATCGTCGTTTCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGGTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGGCGGACTCGGTTCTATCGTGTTGGGGCtggg > 1:176249/1‑249 (MQ=255) gggATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACCACGTGGGAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGGTGCCGGGTTAACAACGTTTCTTGCGCTGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATTTTTGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTTGTTGCAAACTGTCTGGTTTCTGGACCCGGGTCTCTCGTGATGGGTCTGTGGGCt > 1:5603/1‑250 (MQ=255) tttCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCCACGCCCGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGGAGTGGGTTCCCGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGGCATCGTCCTTCCAGGGATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCCCCTGCGGCCGCGTTTGTTGCAAACTTTCTGGTTGCTGGGCTCGGTTCTATCGTGATggggtgttggggtaatatgcc > 2:18219/1‑233 (MQ=255) aTGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCAATCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGGTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCCGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGGCTCGGTTCTATCGTGGTGGGTGTGTGGGGTAATATGCCGTTggg > 1:384641/1‑250 (MQ=255) tCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTTAAAATTCACAACCTGGAAGCA‑CCGT‑CCGTCAGGAAGGGGTTGCCGGGTTTAAAAAGTTTTTGGCGATGGTCTACTCGGGCATCGGCGTTCCCGGGAAGTTTAGGAAAGCAGGGTTCCCGCCTGCGGCCGCTTTCGTTGGAAACTGTCTGGTTGCTTGACTCGGTTTTATCGTGGTGGGGCTTTggggtcatcttgcgttgggggt > 2:396908/1‑232 (MQ=255) 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2:25993/1‑204 (MQ=255) gggTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGtt < 1:234833/251‑1 (MQ=255) aacGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTc < 1:521327/244‑1 (MQ=255) aacGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTc > 2:521327/1‑244 (MQ=255) aacGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATgg > 1:15713/1‑251 (MQ=255) tttCTGGGGATGTTCTACTCGGTCATCTTCGTTCCAGGTATGTGGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGgtg < 2:328340/250‑1 (MQ=255) ggCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGt > 2:348798/1‑251 (MQ=255) 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cccGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCt < 1:110595/250‑1 (MQ=255) cccGCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTc > 2:427662/1‑251 (MQ=255) gCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCt < 1:400444/157‑1 (MQ=255) gCCTGCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCt > 2:400444/1‑157 (MQ=255) gCGGCAGCTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGgtgt < 1:310508/251‑1 (MQ=255) agctttCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGgcgc > 1:413657/4‑251 (MQ=255) gctttCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCGCGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCgca < 2:454493/249‑1 (MQ=255) tttCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTggg > 1:50844/1‑156 (MQ=255) tttCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTggg < 2:50844/156‑1 (MQ=255) cGTTGCAACCTGTCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCgcacggc > 2:102392/1‑250 (MQ=255) tCTGGTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTACGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGt > 2:170938/1‑250 (MQ=255) ggTTGCTGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTAt < 2:211770/249‑1 (MQ=255) | CACGCATCTTGACGAAAATTAAACTCTCAGGGGATGTTTTCTTATGTCTACGCCATCAGCGCGTACCGGCGGTTCACTCGACGCCTGGTTTAAAATTTCACAACGTGGAAGCA‑CTGT‑CCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCCTGATGGGTGTGCTGTTTACGGTAATTTCTGCCACGGGTATCCGTAGCTGGATTTTGCGCAACTTGCCTCACGGTGTGGCGCACGGCACGGGGATTGGTAT > NC_000913/4278436‑4278924 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |