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ggTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑t < 1:387925/251‑1 (MQ=255) ggTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGGGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑CTCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGGTTGAAGAAGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑t > 1:292073/1‑251 (MQ=255) ggTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGGGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTTAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTTT‑CAAACCGTATGGTCTGGGTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGGGCAG‑ATGGGCTTGTTTGccagataggaa > 2:557558/1‑241 (MQ=255) 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tccGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGGGCTGTTTCTCT‑AATTCTGTCGGGTTAACG‑ATCTGG‑GTACCGCGGTGAA‑TCATATTTT‑TCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTTT‑CAAACCGTATGGTTTGGTTTTAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTTACGCAAAGtt > 1:378837/3‑251 (MQ=255) gACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCCGCTGGGGCGGTTTCTCT‑CCTTCTGTCGGATTAAAG‑AATTGG‑GTACCGCCTTGTA‑TTATATTTT‑TCCACTGCCT‑A‑CTGGCGGC‑ATTTTAT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTTGAGATGATCCAAACA‑GTGCCGCGCTGGGGGAG‑AGGCGCCTGCTTGCCCCCAAACAAATGGGG‑ATGCCCCCGCCTTTAAAGCaaaagt > 2:270907/1‑248 (MQ=255) aCGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGGGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGGTTAACG‑ATCTTG‑ATACCGCGGTGAA‑TCCTATTTT‑CCCATTTCCT‑A‑CTTGCGAC‑CTTTTCT‑CAAACCGGATGGGCTGGCTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTTCTTTCCCCAGAACCA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAggtc > 2:35885/1‑248 (MQ=255) 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aaCCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCaa < 1:500294/251‑1 (MQ=255) aCCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAAt < 1:177425/251‑1 (MQ=255) gctatatCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCAc < 1:402072/248‑1 (MQ=255) aCCATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCa < 1:72189/251‑1 (MQ=255) ccATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCAc < 2:42826/251‑1 (MQ=255) aaTCGGCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACGaa < 1:77009/250‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACGAATAcc > 1:529124/1‑249 (MQ=255) tGGTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGATGAATACCAGa > 2:344978/1‑250 (MQ=255) ggTGCTGTTTCTCT‑CATTCTGTCGGATTAACG‑ATCTGG‑ATACCGCGTTGAA‑TCATATTTT‑CCCATTGCCT‑A‑CTGGCGAC‑ATTTTCT‑CAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCA‑GTGCCGAGCTGGTGCAG‑ATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAA‑TGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACGAATACCAGAAc > 1:53957/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |